杉并动画博物馆是位于日本东京都杉并区上荻的一个有关于动画的综合博物馆。
从于2003年5月开设的杉并区的设施杉并动画资料馆为根本而扩充而成，于2005年3月5日正式开放。不像三鹰之森吉卜力美术馆那样为特定作家而设的博物馆，而是以全部动画作为对象的博物馆，为日本国内首个这样的设施。
由日本动画协会负责营运，馆内分为多个区域，除了用图像和映像说明动画的历史和制作过程外，也设有放映室把图书馆持有的动画作品播放。另外也设有录音室，能让参观者体验动画的后期配音及效果声效制作等及处理间介绍监督、作画监督、美术监督的工作，也包括传统动画（Cell Animation）、由分镜至后期制作的制作流程。设有工作坊让在场人士体验仕上（即上色）和编集及初级数码动画。1年内也有3至4次的焦点作品展出，介绍原作者及登场角色等。近期展出包括蜡笔小新等。
馆长为铃木伸一。以藤子不二雄的作品登场人物小池先生的模型闻名。
因3月11日发生的日本东北地方太平洋海峡地震而须要临时闭馆，由原定的3月下旬重开，延迟至4月下旬。
