水飞蓟素（英语：Silibinin (INN)）是种抗氧化剂和药物，从一种名为乳蓟（Milk Thistle）的植物提炼而成，是该植物的主要活性成分之一。本药获批准用于治疗肝中毒、慢性肝炎及肝硬化，但其效用尚未完全确立。Silymarin是乳蓟的一种标准提取物，其主要成分除了水飞蓟素外还有几种黄酮木酚（英语：Flavonolignan）。
尽管水飞蓟素拥有多个羟基，其水溶性并不高。Silipide（商品名 Siliphos）是磷脂酰胆碱和水飞蓟素的超分子化合物，其生物利用度大为提升。两个研究分别指出，相比未经修饰的水飞蓟素，Silipide的生物利用度要高出4.6倍和10倍。除此以外，文献报导，水飞蓟素和β环糊精的超分子化合物水溶性也有显著改善，而水飞蓟素的糖苷则具备更高的水溶性和更强的肝脏保护作用。
作为一种黄酮类化合物，水飞蓟素可抑制P-糖蛋白（英语：P-glycoprotein）辅助的细胞外流。由于许多药物是P-糖蛋白的底物，对P-糖蛋白的调节作用或会改变其他药物的吸收和生物利用度。再者，水飞蓟素可抑制细胞色素P450酶，故水飞蓟素很可能和大多数药物存在药物相互作用。
在晚期前列腺癌病人进行的第一期临床研究指出，每日高达13克剂量的水飞蓟素耐受性良好。最常见的副作用为无症状的肝功能异常，例如胆红素和谷丙转氨酶升高。动物模型之中未曾侦测出任何的胚胎毒性。
考科蓝于2007年的系统综述指出，基于18个临床研究和1088名酒精性及/或病毒性肝炎（乙型、丙形）病人的数据，利用水飞蓟来治疗这些病人的好处值得商榷，而且缺乏高质量的证据来支持这种疗法。综述认为需要进行更多高质量随机对照临床研究才可得出结论。研究人员正探讨水飞蓟素在治疗癌症方面的应用，这是因为水飞蓟素能压抑STAT3的信号转导和干扰其他的生物化学过程。根据英国癌症研究中心（英语：Cancer Research UK），互联网上出现不少声称水飞蓟能减缓某些癌症的宣传信息，但这些讲法目前仍未有足够证据支持。
在某些欧洲国家，水飞蓟素是种临床用药，商品名为Legalon和Silimarit，可用作治疗肝中毒（例如毒鹅膏中毒）和慢性肝炎及肝硬化的辅助治疗。这些制剂是水飞蓟素在2'和3'位置酯化嫁接双氢琥珀酸后中和所得的钠盐，水溶性良好，适合经口服以外的途径给药。2011年，欧盟给予Legalon罕见病药用品待遇，适应症为防止肝脏移植者受丙型肝炎复发所害。
皮肤护理方面，水飞蓟素具备多重功效，包括保护肌肤免受环境毒素侵害、抗发炎功效、抑制紫外线引起的表皮增生（英语：Hyperplasia）和皮肤癌、预防晒伤、以及促进修复紫外线引起的DNA损伤。
水飞蓟素可透过利用水飞蓟的伤愈组织（英语：Callus (cell biology)）或细胞悬浮液进行植物组织培养大量制取，吡嗪酰胺的衍生物可诱导水飞蓟细胞合成包括水飞蓟素在内的黄酮醇-木质素加成物。
