自然指数（英语：Nature Index）是自然科研的一个数据库，从2016年起开始推出，主要跟踪机构和国家的科研产出。自然指数根据在领先期刊发表的论文及其数量，对机构（大学、研究机构、公司等）和国家进行排名，在整体排名下还有四个分支领域排名，包括物理学、化学、地球科学、生命科学。
自然指数仅统计在82种期刊上发表的文章，期刊名录由独立委员会选择，如果一篇论文有多个机构/国家参与，会假定所有成员平等参与了文章，从而进行相应的划分。
根据2020年自然指数，2019年在自然指数期刊上发表论文最多的25个机构是：
根据2020年自然指数，2019年在自然指数期刊上发表论文最多的25个国家是：
