冯琦（1558年11月23日－1603年），字用韫，号琢庵，山东青州府临朐县人，明朝政治人物。
出临朐冯氏，冯裕曾孙。生于嘉靖戊午十一月二十三日。自幼颖慧绝人，授书日记千言，万历五年（1577年）沈懋学榜二甲第二十二名进士。改庶吉士，历任翰林院编修，纂修《大明会典》，书成，升侍读，充讲筵。历官礼部右侍郎，二十九年改吏部右侍郎，兼翰林院侍读学士，典会试，改左侍郎，寻升礼部尚书兼翰林院学士。张居正称其“此幼而硕者，国器也”。万历二十八年余继登去世，冯琦继任礼部尚书，对于思想界的“异端邪说”极其不满，并将矛头指向李贽，指其“背弃孔孟，诽毁程朱”。 万历三十年五月，礼部侍郎冯琦上言矿税之害：“滇以张安民故，火厂房矣；粤以李凤酿祸，欲刃其腹矣；陕以委官迫死县令，民汹汹不安矣；两淮以激变地方，劫毁官舍钱粮矣；辽左以余东翥故，碎尸抄家矣。土崩瓦解，乱在旦夕，皇上能无动心乎？”但无下文。万历三十一年（1603年），赴福王喜宴时昏倒，回家后一病不起，赠太子少保，谥文敏。
神宗年间，词馆中以于慎行及冯琦文学为一时之冠。编有《经济类编》百卷，近三百万字。沈云龙编《明代传记丛刊》收入《冯琢庵先生北海集》。又曾撰《宋史纪事本末》以续《通鉴纪事本末》，未完稿而逝。
曾祖父冯裕，曾任按察司副使 赠布政司右布政使；祖父冯惟重，曾任行人 赠兵部主事；父亲冯子履，曾任按察司副使。母宋氏（封安人）。
