α-变形菌（Alphaproteobacteria）是变形菌门（Proteobacteria）下的一个纲。此纲的成员变异性极大，且共通点极少，但他们确实系出同源。α-变形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些包内寄生的物种缺少肽聚糖，而造成革兰氏染色变异。
α-变形菌包含多种细菌，其中包含光自营细菌、植物共生菌（如根瘤菌）、内共生细菌（如），和胞内寄生细菌（如立克次体）。
此外，本纲还包含已灭绝的Proto-mitochondrion（英语：Proto-mitochondrion）。真核生物的祖先摄入了此种细菌，进行内共生作用，成为后来的线粒体。还有一种生物技术上很喜欢使用的农杆菌（Rhizobium radiobacter）也是本纲成员，科学家常常使用本物种来将外来DNA导入植物基因体中。另外，一些光自营生物像是遍在远洋杆菌（）也属于此纲，α-变形菌的微生物可能占了海洋微生物的10%左右。
关于本纲所属的目，有人反对现行的分类法，尤其是的地位，但大体上大家还是普遍接受。细菌的分类学一直是分类学家相当头痛的问题，因为细菌的基因会彼此互相交流，且基因歧异度相当高（像是遍在远洋杆菌由于他的寄生行为，就会精简化他的基因体）。在某些目中，其成员的GC含量变异也大的夸张。举个例子，像是、立克次体目（）和三者的基因体都含有高AT含量，有人认为那其实是趋同演化所导致的假象，而反对方也有他们自己的论述。后来有人发现用以判断分类依据的rRNA中，GC含量好像好像不太会受基因体变异影响。因此，rRNA中GC含量较高的 就被和低GC含量的和立克次体目分开了。
α-变形菌纲下有三个亚纲、立克次体亚纲（）和柄杆菌亚纲（）。基群为，此类别包含了许多趋磁细菌（由于趋磁细菌为多系群，因此只有部分包含于α-变形菌之下）立克次体亚纲则由细胞内寄生的立克次体目（），以及可以在胞外单独生存的。柄杆菌亚纲则由、红螺旋菌目（）、鞘脂单胞菌目（）、红细菌目（）、柄杆菌目（）、、、短小盒菌目（），和。
以下表格是根据美国国家生物技术信息中心（NCBI）而树状图则是根据'The All-Species Living Tree' Project（英语：'The All-Species Living Tree' Project）所提供的16s rRNA分析结果
? ♠ (Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973
? ♠ Lee et al. 2007
? ♠ Kwon et al. 2005
? Bazylinski et al. 2012 (in press)
? ♠ Lambina et al. 1983
? ♠ Cai 2010
? Pagnier et al. 2011
? ♠
? ♠ Lee 2006
? ♠
? Muir et al. 1990
? Muir et al. 1990
红螺菌科 2
红螺菌科 Rhodospirillaceae 3
红螺菌科 Rhodospirillaceae 4
Maszenan et al. 2005
Albuquerque et al. 2008
Acetobacteraceae
立克次体目 Rickettsiales （包含线粒体）
Sphingomonadaceae （包含Erythrobacteraceae, , ）
(Drews 1982) Imhoff et al. 1998
红螺菌科 1
根瘤菌目
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