藤原氏（Fujiwara）是一个日本贵族的姓氏，早在飞鸟时代已经存在。在平安时代以前，藤原氏的族人均以本姓藤原称呼；而镰仓时代以后除公文书外，多以家名（日语：家名）（如近卫、九条）称呼。
藤原氏源自中臣镰足因为大化改新的功绩，被天智天皇赐姓藤原，略称藤姓。奈良时代，藤原不比等之女宫子、光明子先后入宫，是藤原氏与天皇皇室连姻的滥觞；不比等子孙后分为南家（英语：Nanke (Fujiwara)）、北家、式家（英语：Shikike）、京家（英语：Kyōke）四家。
平安时代，藤原北家借由与皇室的姻亲关系、以及自身的政经实力，以摄政或关白之名义长期左右朝政，称为摄关政治，是藤原北家的全盛时期，并确立摄政关白由北家嫡流出任的传统。
北家嫡流（后被称为摄关家）在平安时代末期分为近卫、松殿（日语：松殿家）、九条三家，其后松殿家衰微，在镰仓时代由近卫家分出鹰司家，由九条家分出二条家和一条家，近卫家、鹰司家、九条家、二条家、一条家被称为五摄家。而近卫、鹰司、一条三家在江户时代，由于曾从日本皇室成员中过继继承人，便被称为皇别摄家。
除五摄家外，藤原氏仍有为很多支流，如：三条家（日语：三条家）、西园寺家、花山院家、四条家（日语：四条家）、劝修寺家（日语：勧修寺家）、日野家（日语：日野家）、中御门家（日语：中御門家）、七条家（日语：七条家）、八条家（日语：八条家）等。各地也有以藤原氏为本家的分支，如近藤、远藤、安藤、加藤、佐藤、齐藤、斋藤、武藤。
而藤原北家的各个分支是堂上家的主体。
在明治维新时，因为明治天皇下了苗字必称令（日语：平民苗字必称義務令），以便订定户籍，所有人民都要有姓氏，有部分地区人改姓藤原，但这些人物与真正的藤原氏并无明确的血缘关系，根据研究许多选择藤原做为姓氏者，背景来源从为庶出子女、曾在藤原氏族下工作但无血缘的仆役与武士，甚至是冒名的骗子都有，在现在藤原氏颇为普遍。而原先的藤原氏，现在多以家名（日语：家名）（如近卫、西园寺、一条）为姓氏。
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