2006年大西洋飓风季时间轴中记录了全年大西洋盆地所有热带和亚热带气旋形成、增强、减弱、登陆、转变成温带气旋以及消散的具体信息。2006年大西洋飓风季于2006年6月1日正式开始，同年11月30日结束，传统上这样的日期界定了一年中绝大多数热带气旋在大西洋形成的时间段，这一飓风季是继2001年大西洋飓风季以来第一个没有任何一场飓风在美国登陆的大西洋飓风季，也是继1994年大西洋飓风季以来第一次在整个十月份都没有热带气旋形成。美国国家飓风中心每年都会对前一年飓风季的所有天气系统进行重新分析，并根据结果更新其风暴数据库，因此以下时间轴中还包括实际操作中没有发布的信息。包括最大持续风速、位置、距离在内的所有数字都是经四舍五入换算成整数。
2006年大西洋飓风季的活动程度与前一年大西洋飓风季相比远远不及。起初气象学家预计在极其活跃的2005年大西洋飓风季后，2006年的活动程度应该只会略低。然而，2006年迅速形成的厄尔尼诺-南方涛动现象、大西洋热带海域上空的撒哈拉空气层，以及以百慕大为中心的亚速尔高压这一强大二级高气压的持续存在，都令2006年大西洋飓风季的活动程度大幅降低。从10月2日以后一直到飓风季结束都完全没有热带气旋形成。2005年12月底形成的热带风暴泽塔一直持续到了2006年1月初，成为有纪录以来第二个跨日历年的大西洋风暴。虽然其存在时间不在任何一年飓风季的正式时间段里，但仍然可以视为2005和2006年大西洋飓风季的一部分。
