王芝瑞(?—1648年5月9日(永历二年闰三月癸未)),字锺淑,号静川,应天府江宁县人,明朝、南明政治人物。
王芝瑞是万历四十六年(1618年)戊午科举人 ,崇祯四年(1631年)成进士,授行人,历任验封主事、员外郎。有宗室郡王应降授将军,就向他行贿三千以违制袭封王爵,他立刻驳斥;政府为该名宗室说情,但最终并不允许袭封。真人张应京面见崇祯帝建坛求雪,没有效果;惟崇祯帝依然器重张应京,在他请求下,让他住在魏忠贤故宅作为策勋的府邸。事情颁布后,王芝瑞说:“有功的人才能赐与宅邸。张应京只是一名真人,获得高爵厚禄,而且求雪无效,凭什么得策勋?”最后也不能阻止。周延儒再次出任首辅,王芝瑞是他以前取录的进士,吏部有官职出缺,周延儒打算让王芝瑞补任。王芝瑞说:“先生出山,不满足众望,将失败是朝廷之事。我离开也嫌不够快,敢扰乱吗?”坚持辞官归乡。
后来王芝瑞再次获起用为四川督学佥事,帮助王应熊筹措粮饷有功。弘光元年(1645年),他奉朝廷命令守江,寇盗不敢渡河;擢任尚宝少卿,任命的诏令尚未到达,张献忠就在闰六月带兵向南,王芝瑞于江上拒守。樊一蘅轻敌战败被他所救,但迷路遇上敌寇伤及马匹,后军来到得免,退入永宁,不久当地也失陷。最初曾英得王芝瑞提拔,王应熊命他攻打寇盗、恢复永宁,而王芝瑞则守卫遵义。隆武帝继位,征召他担任光禄少卿,擢官兵部右侍郎、佥都御史巡抚四川。他接受任命后到达湖南,途中福京失守,因此依附武冈的刘承胤。刘承胤计划拥立岷王朱禋,王芝瑞不断阻止,几乎被杀害,逃入广西,黄尚宾在万年城带兵迎接。永历二年闰三月(1648年),永历帝招任他为吏部左侍郎,拜命后很快去世。