鲁凯语音系（Rukai phonology）为鲁凯语之音系。而其音系之音位大都使用适当的Unicode符号来标示。在台湾南岛语的书写系统的订定上，元辅音之音系表原则上都是先“发音部位”（横列）、后“发音方法”（纵列）、再考量“清浊音”，来订定其音系之音位架构。
万山鲁凯语是分歧性最高的鲁凯方言。李壬癸院士(2001)将鲁凯语分为几个分支如下：
李壬癸院士认为鲁凯语是第1个从原始南岛语分裂出来的南岛语言。下列为李壬癸院士所评估出来的台湾南岛语的分裂时期。Li (2008:215)
大多数的鲁凯语方言有4个元音，以及翘舌音和齿间音(Interdental consonant)等辅音。同样雾台鲁凯语有4个元音，/i ə a u/。/ə/不是一个schwa(schwa)音，而是一个全元音。字词在音位上是以一辅音加上一回声元音(echo vowel)来结尾、回声元音属于/i ə u/其中之一， 而不是如形态音位的(morphophonology)的元音经常在派生上遗失掉。当词干最后的元音是/a/时须用/ə/。
雾台鲁凯语辅音为：
在排湾语及中文的影响下，年轻一辈有时发 /ð/ 音为 音。在大南鲁凯语(Tanan)里，年轻一辈同样地融合 /s/ 音及 /θ/ 音为 音。
在万山鲁凯语(Mantauran)里，清塞音含有擦音于：*b 对 /v/，*d 及 *ɖ 对 /ð/，和 *g 对 /h/ 等之情况中。此些语音现象的研究来自齐莉莎的发表论文(Zeitoun 2007)。总的有辅音 15 个、及元音 4 个如下：
