阿塞拜疆民族主义在共产主义治下发展相对缓慢，与乔治亚人与亚美尼亚人一样，相对视自己为一个持续存在的国家来说，这些外高加索地区的穆斯林较倾向认同自己归属大穆斯林的世界——乌玛。第二次世界大战结束后，当局通过降低伊斯兰的影响来操控阿塞拜疆民族主义。
在苏联统治时期，阿塞拜疆人与亚美尼亚人关系大致良好，但在纳戈尔诺－卡拉巴赫地区的冲突爆发后两国关系迅速恶化，亚美尼亚民族主义（英语：Armenian nationalism）者于1987年开始宣称拥有该区主权。随后两国的种种领土与文化冲突助长了各自的民族主义发展。
自1998年起，亚美尼亚开始指控阿塞拜疆当局在纳希契凡自治共和国境内摧毁许多亚美尼亚十字架石。2006年5月30日，阿塞拜疆拒绝了欧洲议会人员探查其境内的一处古墓，英国保守党外交事务发言人查理‧谭诺克（英语：Charles Tannock）表示：“这和阿富汗塔利班摧毁佛像的行为非常相似，他们已经以混凝土封存了该遗址并在其上建造军营，如果他们没有什么需要隐藏的，我们就不该被拒绝采访。奥地利籍的欧洲议会成员汉斯·斯沃博达（英语：Hannes Swoboda）则说希望能在秋季安排访问，他声称：“如果不允许我们访问，等于间接证实发生了坏事，如果有事被隐瞒我们想要知道原因。”他同时警告，任何想要接近欧洲的国家所需满足的最基本条件之一即是尊重其邻国的文化遗产。
经常发表反亚美尼亚言论的阿塞拜疆历史学家法利达‧玛玛朵娃（英语：Farida Mammadova）是阿塞拜疆民族主义的主要拥护者之一。2005年埃里温南部的阿塞拜疆圣殿遭到亚美尼亚人破坏后，她表示整个星球都知道亚美尼亚人以缺乏人类价值而闻名，在居住在其他国家时惯于盗用他人文化的也是亚美尼亚人。英国记者法兰斯‧德瓦尔（英语：Thomas de Waal）表示码码朵娃将高加索阿尔巴尼亚，的历史名称改加诸在现在的亚美尼亚境内，将所有亚美尼亚的土地、遗迹、教堂等都视为“高加索阿尔巴尼亚”的，企图以此概念将亚美尼亚彻底排除在高加索之外，。1975年她拜访纳戈尔诺－卡拉巴赫的甘扎萨尔修道院时宣读了大门上雕刻的文字“I Hasan-Jalal, built this church for my people of Aghvank”（为我阿尔巴尼亚的人民建造这座教堂），其中Aghvank即为高加索阿尔巴尼亚的别名。。
