杜畿（161年－222年），字伯侯，京兆杜陵人。东汉末及三国时曹魏官吏及将领。西汉御史大夫杜延年的后代。
杜畿父亲早死，虽然遭到继母苛待，但杜畿仍孝顺继母，以孝闻名。二十岁时（180年）担任京兆郡功曹，守郑县令。当时县衙囚禁了数百名嫌犯，杜畿亲自到监狱替他们作出裁决，虽然不是人人都得到适当的判决，但郡内的人都对他年少但有大志而感到惊奇。后来举孝廉，担任汉中府丞。后来东汉政局动荡不安，天下大乱，杜畿于是弃官逃到荆州。建安年间，杜畿回到北方，得到曹操的谋士荀彧赏识，于是向曹操推荐杜畿，曹操则任命他为司空司直，调任护羌校尉，使持节领西平太守。
建安十年（205年），曹操平定河北后，北征乌桓。高干趁机在并州反抗曹操，当时河东太守王邑被征召到别处，河东人卫固和范先以请王邑回来为名，与高干暗中勾结，曹操问荀彧谁能镇守河东，荀彧推荐杜畿，于是任命杜畿为河东太守，卫固等人于是命一支数千人的军队断绝陕津，令杜畿不能前进，曹操派夏侯惇讨伐，但还未到，当时有人向杜畿说要一支大军才可解决河东的问题，杜畿则认为河东不是人人都想叛乱，只是因为害怕才听命于卫固。若果强行讨伐，即使战胜也害苦了当地的人；若果失败，更令到附近的人支援卫固，叛乱不会平息。于是打算出其不意，到了当地，卫固一定会假装接受新任太守，然后才用计解决。最终杜畿绕道经郖津渡河。范先有意杀死杜畿来威吓群众，于是在杜畿来时在城门下斩杀主簿以下三十多人，但杜畿行动没有受到影响，卫固认为杀了杜畿只会换来恶名，而且杜畿会受自己制肘，于是奉迎他。杜畿后来调一些人在外，暗中作为自己的援军，又将图谋叛逆的人分散。当时张白骑攻东垣，高干进军濩泽。杜畿知道各县都依附自己时，就领数十骑兵出城防守，各县吏民大多举城帮助杜畿，数十日间就得四千多兵。卫固和高干、张晟等人共同攻打杜畿，不能攻破，掳略诸县时又因杜畿坚壁清野的策略而一无所得。后来曹操派来的大军赶到，击败高干和张晟，卫固等人被诛杀，其余党众都得到赦免。
杜畿治理河东郡，以无为而治为原则，人民提出诉讼，杜畿只和他们说道理，然后要他们回去思考，还有不满才再来。乡邑父老亦服从，令到郡县少有诉讼。又鼓励人民畜养牛马和家畜和家禽。人民勤于务农，家家都富起来后又讲授武学和开学宫教授经书，令到河东郡有大量儒家学者。
后来韩遂和马超在关中举兵反抗曹操，弘农郡和冯翊郡多个县邑都响应，但河东郡虽然邻接，人民却无异心。曹操率军与叛军对抗时，军粮就完全依靠河东郡供应，到战胜后还余下二十多万斛，曹操因而称赞杜畿，增秩中二千石。曹操征伐据守汉中的张鲁时，杜畿又派五千人运输，虽然要到战争前线，但他们为了不负杜畿所托，没有一人逃亡。魏国建立后任命杜畿为尚书。杜畿管治河东共十六年。
曹操死后，曹丕继任魏王，赐爵关内侯，征召为尚书。曹丕称帝后再进封杜畿为丰乐亭侯，食邑一百户，守司隶校尉。黄初三年（222年），曹丕南征东吴，任命杜畿为尚书仆射，总管留守事务。七月，冀州出现蝗灾，杜畿奉命开仓救济。后来曹丕到许昌时，杜畿都总管留守事务。后来同尚书郎诸葛诞被任命为皇帝制作楼船，两人在陶河试航时遇上大风沉没，诸葛诞幸存、反而杜畿淹死，享年六十二岁，曹丕因杜畿而哭泣。死后获追赠太仆，谥戴侯。
祖先出自《新唐书·宰相世系表》
