玛雅手抄本是前哥伦布时期玛雅文明的文献，是以玛雅文字写在脱毛榕木的内树皮制成的纸上。这些手抄本是由专业抄写员在神明的任命下写成的。玛雅人于5世纪开始制造自己的纸张，罗马人也是于同时代造纸，但玛雅人的纸张更为耐用及适合书写。这些手抄本一般都是以最后存放的城市来命名，留存下来的要以德累斯顿手抄本最为重要。
在16世纪西班牙征服尤卡坦时期，就已经有很多玛雅手抄本存在，但后来被西班牙征服者及祭司大量销毁。而所有在尤卡坦的文献却被迪亚哥·德·兰达主教于1562年7月下令全面销毁。这些文献，加上一些石刻及碑刻，都是玛雅文明现存的主要书写纪录。不过，它们所记载的肯定较石刻或其他铭刻的更为广泛。于1540年有指在危地马拉高原发现的文献中，记载了玛雅超过800年的历史。巴托洛梅·德拉斯·卡萨斯发现了一些玛雅手抄本，但却正被僧侣所烧毁。最后被破坏的文献是于1697年在危地马拉的塔亚沙尔被破坏。 由于所受到的破坏，很多有关玛雅文明的重要资料都被抹煞了。
现时只存有3份手抄本，或是4份手抄本碎片：
德累斯顿手抄本现正存放在德国德累斯顿图书馆内。它是有最详细解释的手抄本，亦是非常重要的艺术作品。很多部分记载了各类仪式，其他则有关天文学。这套手抄本是一本有39页长纸的书籍，每页都是双面记载。这有可能是在西班牙入侵前写成，后来展转间到了欧洲，并于1739年由德累斯顿图书馆所购下。它的复制品自2007年10月就在危地马拉展览。
金星周期是玛雅文明重要历法，而大部分有关资料都可以在德累斯顿手抄本中找到。玛雅人可以非常准确的计算金星周期，在德累斯顿手抄本中第46页至50页来计算金星的位置。这种准确性是因超过很多世纪对金星的观察而获得。金星周期如此重要，是因玛雅人相信它与战争有关，并择日进行加冕或开战，当金星上升时，就是开战的时候。玛雅亦可能有观察其他的天体，如火星、水星及木星。
马德里手抄本（英语：Madrid Codex (Maya)）的手工虽然较差，但却是由8个抄写员写成，内容比德累斯顿手抄本更为多样。它是由荷南·科尔蒂斯送回西班牙，而现正存放在马德里的美洲博物馆（英语：Museum of the Americas (Madrid)）内。它共有112页，曾经分为两个独立部分，并于1888年重组。
巴黎手抄本（英语：Paris Codex）内记述了盾及卡盾的预言（详细参看玛雅历），以及玛雅天文，集两者制成了方士秘录（英语：Chilam Balam）。巴黎手抄本最先于1832年在巴黎法国国家图书馆出现，3年后伦巴底艺术家Agostino Aglio（英语：Agostino Aglio）为金世葆勋爵（英语：Edward King, Viscount Kingsborough）造了一个复本。这个复本的原稿已经遗失，只有一些复印本留在芝加哥的纽波瑞图书馆（英语：Newberry Library）。
1859年法国东方学者莱昂·戴罗斯尼（法语：Léon de Rosny）在法国国家图书馆炉角发现了一篮旧文献，这篮文献已被抛弃及被人所遗忘。 他在这篮文献中却发现了巴黎手抄本，故巴黎手抄本的状况较差。戴罗斯尼是因在文献上见到一字而发现巴黎手抄本，故将之命名为，但一般都称呼它为巴黎手抄本。
虽然其他的三个手抄本都是在19世纪出现，但格罗里手抄本（英语：Maya Codex of Mexico）却要到1970年代才出现。这个玛雅手抄本是在洞穴中发现，但就其可信性则被受质疑。这个手抄本是只有11页的碎片，现正存放在墨西哥的博物馆内，并不公开展览。每页都较其他手抄本小资料，并且都是显示了一个向左望的英雄或神祇。每页最顶处有一个数字，而左排则有相信是日子的列表。
由于玛雅手抄本较为稀有及重要，故任何有关发现玛雅手抄本的消息都备受关注。在墓穴的考古挖掘发现了一些方形泥块，这正是手抄本的遗迹，但所有的有机物都已被侵蚀。已知最古老的手抄本都是在危地马拉的瓦哈克通、基切的拉巴、伯利兹的阿顿哈及洪都拉斯的科潘发现用来殓葬的祭物。6个的手抄本可以追溯至古典时期早期及后期，并后古典时期初期。不过这些手抄本因压力及湿度的改变，有机底层全被消去，手抄本都不能开启，或是非常细小的薄层，没法看得到其内容。
由20世纪开始，出现了不同的伪造手抄本。当格罗里手抄本出现时，有很多著名的玛雅学者都认为它是精美的伪造品。纵然有更多的证据证明其真实性，但仍有很多学者质疑这是否为伪造品。
