全基因组泛癌分析

✍ dations ◷ 2025-06-28 19:24:01 #癌症,遗传学

全基因组泛癌分析(英语:Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes,PCAWG)是由国际癌症基因组联盟(ICGC)组织的一个国际性合作项目,对超过2600组癌细胞基因进行分析。

1984年,人类基因组计划被提出,旨在测定人类染色体的核苷酸序列。这一计划自1990年启动开始,于2003年完成。在这一计划中,有研究者希望借助同样的手段,通过对肿瘤基因组的表征,深入研究肿瘤。因此,癌症基因组图谱计划(TCGA)于2006年启动,对33个癌症类型和2万个癌症以及正常组织的分子特征进行测序分析。2008年,ICGC成立,负责系统性分析癌症基因突变。由于TCGA和ICGC的研究范围重叠,为实现泛癌分析的标准化,提高研究效率,由来自超过700个研究机构的研究者共同形成了PCAWG联盟,根据癌症基因的不同分析方向分为16个小组共同研究。

PCAWG项目采纳了来自2793名捐献者的基因数据,数据总量接近800TB。2020年2月,ICGC发表这一项目的研究成果,是目前最全面的癌症基因组分析。

2020年2月5日,PCAWG项目在Nature期刊上首先发表了6篇主要的研究成果。Nature的多个子刊中也刊登了多个项目阶段性成果。这6篇文章分别触及癌症基因组携带的驱动突变、非编码区域的改变、体细胞突变的特征、结构变异、肿瘤基因进化历程和RNA突变。

在对PCAWG数据库中的38种肿瘤类型所包含的2658个肿瘤全基因组进行整体分析后发现,当统计编码和非编码序列时,每一个肿瘤基因组平均携带4-5个驱动突变。

相关

  • 索姆省索姆省(法语:Somme)是法国上法兰西大区所辖的省份,位于法国北部,由境内的索姆河得名。该省编号为80。第一次世界大战中著名的索姆河战役就发生于此。5个海外省及大区
  • 打稻草人稻草人论证(英语:straw man)或稻草人谬误、攻击稻草人、刺稻草人、打稻草人是曲解对方的论点,针对曲解后的论点(替身稻草人)攻击,再宣称已推翻对方论点的论证方式,是一种非形式谬误
  • 紫外线指数紫外线指数(英语:Ultra-violet Index)指的是在某一天某个地点受到太阳紫外线(UV)辐射强度的国际计量标准。这种级数主要用于日常预报中且针对对象是一般大众。它的目的是用来保护
  • 纱线是一种很长的纤维,用于纺织、缝纫、编织、制绳等。纱线可以从多种天然或合成纤维制成,比如棉、丝绸、竹、麻、大豆,羊、骆驼、猫、狗、狐、兔等动物的毛,以及各种人造纤维。
  • 布劳恩卡尔·费迪南德·布劳恩(德语:Karl Ferdinand Braun,1850年6月6日-1918年4月20日),德国物理学家,诺贝尔物理学奖获得者,阴极射线管的发明者。1850年6月6日,布劳恩出生在富尔达,父亲是
  • 下通古斯河下通古斯河(俄语:Нижняя Тунгуска)是一条位于西伯利亚的河流。流经俄罗斯伊尔库茨克州和克拉斯诺亚斯克边疆区,全长2,989公里,是叶尼塞河的右支,在图鲁汉斯克(英语:Tu
  • 南乔治亚和南桑威奇群岛面积国家领袖立国历史南乔治亚和南桑威奇群岛(英语:South Georgia and the South Sandwich Islands;缩写:SGSSI)为英国在大西洋南部的海外属地。该属地由一连串既偏远且荒凉的岛
  • 1932年7月德国国会选举弗朗茨·冯·帕彭 Non-partisan无 (帕彭保留,成为未选举出的总理) 1932年7月德国国会选举于1932年7月31日在德国举行,紧接着魏玛共和国国会的提前解散。在这次国会选举中,由阿
  • 斯海尔德河斯海尔德河(荷兰语:Schelde,.mw-parser-output .IPA{font-family:"Charis SIL","Doulos SIL","Linux Libertine","Segoe UI","Lucida Sans Unicode","Code2000","Gentium","Gen
  • 维雷希斯宫维雷希斯宫(立陶宛语:Vileišis Palace)是位于立陶宛首都维尔纽斯的一座宫殿建筑,为巴洛克式建筑。维雷希斯宫修建于1904年。现在维雷希斯宫是立陶宛文学与民俗学研究所的所在地