跨性别工程师是不符合传统性别二分的工程师。
琳·康维是最早的跨性别工程师之一，从1964年开始在IBM工作，对乱序执行的发展打下基础，1968 因为进行性别转换手术而被开除。完成转换后，他被迫隐藏自己的跨性别身份，以女工程师的身份接其他工作。在接近退休的1999年，他开始向朋友公开自己的跨性别身份，并加入争取跨性别平权的社会运动，并在2013年争取到将跨性别列入IEEE行为准则中。
跨性别工程师有时在求职或工作时，有时候是会遇到不友善的对待，有的公司因此被提告。
也有些公司对跨性别工程师比较友善，跨性别工程师可以自己选择偏好的名字、性别和人称代词，雇用不同背景的工程师有助于考量各种使用者的感受。
自由软件社群可能对跨性别者比较友善，跨性别工程师唐凤认为网络世界不特别在意人的性别，更看重人的价值，而非刻板印象和标签。
超感八人组影集的主角之一是跨性别工程师，这也是第一次有跨性别演员在主流影剧中饰演主角。
