万元吉(1603年-1646年),字吉人,江西南昌人,万六吉的兄长。
天启五年(1625年)乙丑科进士,任潮州推官,捕得盗贼李守志,解散其党,后任南京职方主事。崇祯末年,曾随杨嗣昌出征,与石柱秦良玉合兵击贼,招降关索、惠登相、王光思等。南明时,擢太仆寺少卿,隆武帝朱聿键授兵部右侍郎兼右副都御史,总督江西、湖广诸军。隆武二年(清顺治三年,1646年)入赣州,是年四月十四日,清军将领高进库由万安皂口进攻赣州,偕同杨廷麟据城坚守。赣州被攻陷,杨延麟殉清水塘,元吉投章江死,“自五月至于十月,战中自尽,斗米至八钱,饿死载道,人无叛志。”。著有《墨山草堂诗文集》、《燕游记》、《寓永集》等。