客家基因族谱为替全世界的客家人建立基因家谱的科学验证计划，让客家人可以通过DNA检测寻根问祖，并用群体遗传学和分子人类学的方法研讨客家人的迁移、形成、和发展的历史。客家是汉族的一个民系，位于中国福建省宁化石壁村是客家民系形成的重要地域，大多数在中国南迁的历代客家人都曾聚居宁化石壁村，之后再陆续向外迁移。宁化石壁村因此被称为“客家祖地”。客家基因族谱基于客家祖地的石壁并以遗传学、人类学方面的研究，作为科学证据。
福建省宁化县长年举办祭祖大典活动，总计先后约有20多个国家和地区的30多万客家后裔前来探询祖源。海内外客属社团将近约千名客家后裔会一起聚会并祭拜祖先。至2010年为止已连续举办了16届。
2010年9月，由宁化客家研究会与江苏无锡汇泽基因科技公司联合开始进行进行的客家基因族谱，在宁化的100多个姓氏家族中收集了DNA样品。在2010年12月1-2日在中国福建省宁化县石壁举办的客家祭祖大典上，客家基因族谱举办启动仪式，并向祭祖的来宾提供了免费客家基因族谱检测。
客家基因族谱项目在2011年8月起发布结果，参与的100多个姓氏的客家民众可以在网上进行查询了解自己祖先历史。项目将系统分析数据，希望提供客家人迁移历史的新证据，将在2011年10月15-16日在福建宁化举办成果展览。
客家人属于汉族的独特传统的分支民系。客家人是在唐宋前后由中原迁至南方，后定居于福建省、广东省、江西省和广西省的客家地区，并繁衍到台湾、东南亚等更广大地区。据统计，全世界现有客家人1.2亿，遍布五大洲与80多个国家和地区。客家人保留了许多古代中原汉人的文化和语言，客家学对于研究汉民族的文化历史和人类学有一定贡献。客家人的起源和发展过程，在学术界还存在广泛争议。宁化石壁是唐末客家先民南迁的主要集散地，很多客家人的家谱对此有记载。客家人尊崇祖先，很多家族都有详细家谱，每年都有很多人从海外来到客家人先祖繁衍生息的故地寻根问祖，宁化的客家祖地每年都进行客家祭祖大典。
“客家人基因族谱”目的是让客家人，无论有家谱记载或没有，都可以通过它来寻根问祖；可以让客家人找到自己几百年前、上千年前的“祖地”，为断了联系的家族分支用DNA信息重建家谱。
检测Y染色体DNA的短串重复序列（Short Tandem Repeat, STR）和单核苷酸多态性（SNP）。再用群体遗传学方法作分析，并用客家人的历史文献资料作为参考。
