首页 >
美国国家生物技术信息中心
✍ dations ◷ 2025-06-06 14:29:03 #美国国家生物技术信息中心
国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,简称NCBI)是美国国家医学图书馆(NLM)的一部分(该图书馆是美国国家卫生研究所的一部分)。NCBI位于美国马里兰州的贝塞斯达,建立于1988年。NCBI设置有与生物技术和生物医学相关的一系列数据库,是生物信息学工具和服务的重要资源。 主要数据库包括DNA序列GenBank,和生物医学文献书目数据库PubMed。 其他数据库包括NCBI表观基因组数据库(英语:NCBI Epigenomics)。 所有这些数据库都可以通过Entrez搜索引擎在线获取。许多受尊敬的研究者在NCBI工作,如比较基因组学领域的一位多产的科学家Eugene Koonin和BLAST序列数据库搜索算法的作者Stephen Altschul。NCBI在研究数据库r3data.org的注册表中列出。NCBI自1992年开始负责维护DNA序列数据库(英语:Biological databases)GenBank。GenBank数据库每日都会实时更新并和另外两家数据库(欧洲的EMBL与日本的DDBJ)交换数据,以确保三家数据库的序列数据的一致性。
自1992开始,NCBI陆续将其它数据库与GenBank整合起来,包括Gene(英语:Gene (database))、在线人类孟德尔遗传数据库、 分子模型数据库(一个蛋白质三维结构数据库)、dbSNP(一个单核苷酸多态性数据库)、Reference Sequence Collection(一个人类基因组图谱)以及分类学浏览方式和美国国家癌症研究所提供的癌症基因组剖析计划(英语:Cancer Genome Project)数据。NCBI也对每一个物种都设立了一个分类编号(taxonomy ID number)。NCBI提供的一些在线软件可供FTP或WWW浏览,比如BLAST序列相似性比对程序,可在15秒内完成与GenBank数据库的序列比较。NCBI书架是一个集合了可以自由获取、下载的线上精选生物医学书籍数据库。截至2011年4月,书架有845本书籍,涵盖广泛的主题包括分子生物学、生物化学、细胞生物学、遗传学,和微生物学。从分子和细胞从角度分析的疾病状态、研究方法,和病毒学。一些书是以前出版的图书的在线版本,而其他如Coffee Break(书)是由NCBI的工作人员编写和编辑。书架是同行评审的Entrez PubMed库的期刊摘要的补充,因为它能提供前沿领域的已确立的的观点,并整理许多不同的零散的研究报告。BLAST是用于计算生物序列之间的序列相似性的算法,例如DNA的核苷酸序列和蛋白质的氨基酸序列。BLAST是查找与同一生物体内或不同生物体中的查询序列相似的序列的有力工具。 它搜索NCBI数据库和服务器上的查询序列,并将结果以选定的格式发布回该人员的浏览器。BLAST的输入序列大部分采用FASTA或Genbank格式,而输出可以以各种格式(如HTML,XML格式和纯文本)传送。 HTML是NCBI网页的默认输出格式。 NCBI-BLAST的结果以图形格式显示,找到所有命中结果,具有具有得分相关数据的命中结果的序列标识符的表格,以及感兴趣序列的比对以及用于这些的类似BLAST得分的命中结果。Entrez全球查询跨数据库搜索系统在NCBI中用于所有主要数据库,如核苷酸和蛋白质序列,蛋白质结构,PubMed,分类学,完整基因组,OMIM等。Entrez是既具有生物医学研究来源的数据的索引和检索系统。NCBI于1991年分发了第一版Entrez,由蛋白质数据库(PDB)和GenBank的核苷酸序列,SWISS-PROT,翻译的GenBank,PIR,PRF和PDB的蛋白质序列组成,PubMed的相关摘要和引文。 Entrez专门设计用于将来自不同来源,数据库和格式的数据集成到统一的信息模型和检索系统中,可以有效地检索相关的参考文献,序列和结构。
相关
- NTA荷兰皇家图书馆(荷兰文:Koninklijke Bibliotheek, KB)位于海牙,成立于1798年,是荷兰的国家图书馆。目前的馆名是1806年路易·波拿巴所命名。皇家图书馆在1993年成为独立机构,但其
- 神经外科学人体解剖学 - 人体生理学 组织学 - 胚胎学 人体寄生虫学 - 免疫学 病理学 - 病理生理学 细胞学 - 营养学 流行病学 - 药理学 - 毒理学神经外科,也常称作脑外科,是外科的一个
- 頭头在解剖学上是指动物的吻端部分,通常包括脑、眼、耳、鼻、口等器官(所有这些器官都支撑着各种感官功能,如视觉、听觉、嗅觉、味觉)。有些非常低等的动物可能没有头部,但多数两侧
- 放射性放射性或辐射性是指某元素的放射性同位素从不稳定的原子核自发地放出射线(如α射线、β射线、γ射线等)而衰变形成另一种同位素(衰变产物),这种现象称为放射性。衰变时放出的能量
- 蛋白质蛋白质(英语:protein,旧称“朊”)是大型生物分子,或高分子,它由一个或多个由α-氨基酸残基组成的长链条组成。α-氨基酸分子呈线性排列,相邻α-氨基酸残基的羧基和氨基通过肽键连接
- 双链DNA反转录病毒双链去氧核糖核酸逆转录病毒(ds-DNA RT)是巴尔的摩病毒分类系统中的第七类病毒(Group VII)。这类病毒一般不被认为是DNA病毒(该分类中的Group I&II),而被认为是逆转录病毒(该分类的G
- X射线晶体学X射线晶体学是一门利用X射线来研究晶体中原子排列的学科。更准确地说,利用电子对X射线的散射作用,X射线晶体学可以获得晶体中电子密度的分布情况,再从中分析获得关于原子位置和
- 碱基核碱基(英语:Nucleobase)是指一类含氮碱基(nitrogenous base),在生物学上通常简单地称之碱基(base)。是在DNA和RNA中,起配对作用的部分。核碱基都是杂环化合物,其氮原子位于环上或取代
- 烹煮烹饪,又称烹调、烹煮、炊煮、造饭、做菜,指将食材处理并制作成食物、菜肴、餐点、膳食的方法。一个好的菜肴,色香味形俱佳,不但让人在食用时感到满足,而且能让食物的营养更容易被
- 双氧水过氧化氢,分子式H2O2,是除水外的另一种氢的氧化物。粘性比水稍微高,化学性质不稳定,一般以30%或60%的水溶液形式存放,其水溶液俗称双氧水。过氧化氢有很强的氧化性,且具弱酸性。纯