染色质免疫沉淀-测序

✍ dations ◷ 2025-06-27 12:47:04 #染色质免疫沉淀-测序
染色质免疫沉淀-测序(英语:ChIP-sequencing,简称为ChIP-seq)被用于分析蛋白质与DNA的交互作用。该技术将染色质免疫沉淀(ChIP)与大规模并行DNA测序结合起来以鉴定与DNA相关蛋白的结合部位。其可被用于精确绘制任意目的蛋白在全基因组上的结合位点。在此之前,ChIP-on-chip是研究这些蛋白-DNA联系的最常用的技术。ChIP-seq主要用于确定转录因子和其他染色质相关蛋白质如何影响表型影响机制。确定蛋白质如何与DNA相互作用来调控基因表达对于充分了解许多生物过程和疾病状态至关重要。这种表观遗传信息与基因型和表达分析是互补的。 ChIP-seq技术目前主要被看作是需要杂交阵列的ChIP-on-Chip的替代品。 这必然会引入一些偏差,因为一个阵列仅限于有固定数量的探针。相反,尽管不同测序技术的测序偏差尚未完全了解,测序被认为偏差较小。与转录因子和其他蛋白质直接物理相互作用的特定DNA位点可通过染色质免疫沉淀被分离出来。 ChIP产生在活体内In vivo兴趣蛋白质结合的目标DNA位点文库。 大规模平行序列分析与全基因组序列数据库结合使用来分析任何蛋白质与DNA的相互作用模式或任何表观遗传染色质修饰的模式。 这可以应用于一系列ChIP蛋白和修饰,如转录因子,聚合酶和转录机制,结构蛋白质,蛋白修饰和DNA修饰。 作为对特异性抗体依赖性的替代方法,已经开发了不同的方法来发现基因组中所有核小体耗尽的(nucleosome-depleted)或核小体扰动(nucleosome-disrupted)的活性调控区的超集,如DNase-Seq和FAIRE-Seq。

相关

  • 极夜极夜,又称永夜,是在地球的两极地区,一日之内,太阳都在地平线以下的现象,即夜长为一个太阳日。如果太阳直射点在哪个半球,另个一个半球的极地附近就会出现极夜现象。极夜的范围与太
  • 拉迪诺语拉迪诺语(希伯来语:.mw-parser-output .script-hebrew,.mw-parser-output .script-Hebr{font-size:1.15em;font-family:"Ezra SIL","Ezra SIL SR","Keter Aram Tsova","Taamey
  • 冷漠冷漠或无情指缺乏情感、兴趣及关切之心。冷漠的人保持着冷淡的态度,或会抑压着担忧、兴奋、动机及或激情,并失去对生命以及世界在情感、社会、灵性、哲理和实质的关心和兴趣。
  • 宏语宏语(Taa、/ˈtɑː/、ǃXoon (!Khong, !Xóõ) /ˈkoʊ/ 或扎希语(Tsasi))属科依桑语系,以音位众多而著称。2002年时,有4200名使用者,主要分布在博茨瓦纳(~4000人)和纳米比亚。
  • SKOS简单知识组织系统(Simple Knowledge Organization System,SKOS),是目前正在发展的简单知识组织描述语言,以RDF Schema设计方式来展现与分享控制的词汇。其可提供一些社群以一种机
  • 透射电子显微镜透射电子显微镜(英语:Transmission electron microscope,缩写:TEM、CTEM),简称透射电镜,是把经加速和聚集的电子束投射到非常薄的样品上,电子与样品中的原子碰撞而改变方向,从而产生
  • 低钠血症低血钠症(英语:Hyponatremia)是人体内血液中的钠含量过低时,所引起的临床病征。低血钠定义为血中钠离子浓度低于135 mmol/L(135 mEq/L),若低于120 mEql/L,则为重度低血钠症。在临床
  • 佛蒙特佛蒙特州(英语:State of Vermont,i/vərˈmɒnt/))是美国第14个州,以其美丽的景色、奶制品、枫糖浆和激进的政治而著称。佛蒙特总共拥有14个县。这14个县,辖下有255个政治单位或地
  • 无体腔动物无体腔动物是指体壁与消化管之间没有体腔而充满中胚层间质的动物。包括扁形动物门和纽形动物门,是最原始的两侧对称动物。
  • 裸露核糖核酸病毒裸露核糖核酸病毒(Naked RNA Viruses)是一类正链核糖核酸病毒。此类病毒的特点是没有衣壳, 自然宿主是真菌。至2015年为止共发现有7个物种,在裸露核糖核酸病毒科下分为两个属