日本在世界动物地理分区上绝大部分属于旧北区,除了琉球群岛属于东洋区外。约有600种鸟类被纪录,其中有13种为特有种,7种为只在日本繁殖的种类。
根据日本鸟学会的分类:
第3类分类不列于此表,因此本表只有565种鸟类。