朱巴县(Juba County)是南苏丹共和国中赤道省的一个县,朱巴市为该县最大的都市,也为省府所在地和国家首都。根据南苏丹独立前的2008年人口普查,朱巴县有人口372,413。
县的东北部是巴丁吉罗国家公园一部分。