核输出序列又称作核输出信号(英语:nuclear export signal,NES)是由四个疏水氨基酸残基组成的蛋白质肽段序列,能将蛋白从细胞核通过核孔复合体核运输到细胞质。与之功能相反的是能将蛋白运入细胞核的核定位序列(英语:nuclear localization signal,NLS)。NES可以被外输蛋白识别并结合。由生物信息学分析发现NES疏水性残基的最常见间隔为LxxxLxxLxL,其中“L”是疏水性残基(通常是白胺酸),“x”则是任何其它氨基酸。这些疏水性残基的间距可以通过检查含有NES的已知结构来解释,因为关键残基通常位于蛋白质内的相邻二级结构的相同面中,这允许它们与输出蛋白相互作用。此外,由于核糖核酸 (RNA) 仅由核苷酸组成,因此它缺乏核出口信号来移出核。故大多数形式的RNA将结合蛋白质分子,来形成能从核中输出的核糖核蛋白复合物。
Eukaryotic Linear Motif resource motif class TRG_NES_CRM1_1 (页面存档备份,存于互联网档案馆)