下文列出部分涉及到维基媒体基金会的诉讼。
2011年5月，路易斯·培根（英语：Louis Bacon）获得一项针对维基媒体基金会的法庭令，要求基金会公开在维基百科上涉嫌毁谤他的编辑的个人资料。但是，由于该项法庭令是在英国获取的，故而无法在美国被执行。
文学代理人芭芭拉·鲍尔（Barbara Bauer）起诉维基媒体基金会毁谤， 她声称维基百科将她列为“最愚蠢的”文学代理人。 但是基于《通信规范法案（英语：Communications Decency Act）》，法院驳回了芭芭拉·鲍尔的起诉。
职业高尔夫球运动员富齐·佐勒（英语：Fuzzy Zoeller）也认为自己被维基百科毁谤，但是他并没有选择起诉维基媒体基金会，因为他的律师告知他，考虑到《通信规范法案》，案件胜算不大。 然后他起诉了编辑所在的迈阿密电脑制造公司，但后来他也放弃了这起诉讼。
2007年，三名法国公民起诉维基媒体基金会，因为维基百科上的某个条目将他们描述为同性恋活动家。 法国法院驳回了有关毁谤和侵犯隐私的案件，裁定维基媒体基金会对维基百科内的文章并不承担连带责任。 法官认为2004年的法国法律限制了基金会的责任，并且侵权内容已经被删除。 法官发现并没有任何法律要求基金会必须检查维基百科的内容，并且“网站负责人如果在事实上不知道网站上的非法内容，那么就不能因为网站上的非法内容要求网站负责人承担民事责任。” 不过法官并没有裁定这些信息是否具有毁谤性。
《淘气马拉塔瓦尼亚：学会对毒品说“不”（英语：Latawnya, the Naughty Horse, Learns to Say "No" to Drugs）》的作者西尔维娅·斯科特·吉布森（Sylvia Scott Gibson）因维基百科对她的书的描述而起诉维基百科。 但是她的起诉被驳回了。
美国作家和记者约翰·席根塔勒于2005年联系维基百科，因为他的条目中出现了不实指控，声称他曾经一度被怀疑与约翰·肯尼迪和博比·肯尼迪暗杀事件直接相关，而且该部分已经加入有四个月了。 约翰·席根塔勒指责维基百科是一个“有缺陷和不负责任的研究工具”，并批评《通信规范法案（英语：Communications Decency Act）》保护了维基百科。这一事件就是席根塔勒传记事件。
2013年5月，美国金融管理学会（英语：American Academy of Financial Management）代表乔治·门茨（George Mentz）表示，维基百科上面有的虚假陈述涉嫌故意发布，这些虚假或无能的维基百科编辑给维基媒体基金会惹来了法律纠纷。
德州仪器公司向维基媒体基金会发送了“《数字千年法案》删除通知（英语：Online Copyright Infringement Liability Limitation Act）”，因为某些特定加密密钥在德州仪器签名密钥事件（英语：Texas Instruments signing key controversy）条目上被公开。一位维基百科编辑随即回复了一封反通知，后由于德州仪器公司未在《数字千年法案》规定的10—14个工作日内作出回复，这些密钥因此又被恢复。
除此之外，维基媒体基金会还曾在《数字千年法案》删除通知的要求下，对英语维基百科中的戴蒙·达什（英语：Damon Dash）和外设组件互连标准条目执行基金会行动。
2010年7月，美国联邦调查局致函维基媒体基金会，要求基金会旗下的维基百科停止使用联邦调查局徽章。 联邦调查局认为维基媒体基金会使用其徽章是违法的，并威胁诉诸法律。维基媒体基金会的律师迈克·戈德温在回函里向联邦调查局发出反通知，声明在维基百科上使用联邦调查局的徽章并不侵权。 他对维基百科的行为作了辩护，拒绝撤除徽章。
2015年3月，维基媒体基金会联合其他团体就美国国家安全局对其上游实施大规模监控（英语：Global surveillance disclosures (2013–present)）而提起诉讼。
