施药院全宗（1526年－1599年），号德运轩，日本战国时代和安土桃山时代的医师。丰臣秀吉的亲信。
全宗出身丹波氏家族，是平安时代名医丹波康赖的二十世孙。祖父宗清、父亲宗忠皆担任权大僧都法印之职。原为比叡山菜树院的住持，1571年织田信长火烧比叡山，全宗还俗(当时规定非出家人不得行医，直至江户年代医师一行仍由寺社奉行管理)并投奔曲直濑道三的门下，学习汉方医学并十分精通。后来受到丰臣秀吉的赏识并成为他的侍医，秀吉取得天下后，于天正年间任命全宗为施药院使，叙从五位下的官阶并给予昇殿的资格，赐姓施药院。施药院于730年由光明皇后创立，是对平民中的病人、孤儿进行保护、治疗、免费提供药物的的救济机构。但经过了八百年历史之后，当时的施药院已经名存实亡。全宗致力于恢复奈良时代的施药院，无论病人高低贵贱皆免费赠送药材以治病。
施药院全宗也是丰臣秀吉身边的重要亲信之一，他曾代表丰臣氏同伊达政宗、佐竹义重等人进行交涉。1587年（天正15年）丰臣秀吉发布的伴天连追放令也是由他执笔写成的。他致力于恢复荒废的比叡山。后陞爵正四位。庆长4年病逝，享年74岁（一说69岁）。
全宗娶永原实贤的女儿为妻，生一子（施药院秀隆）一女，皆先于全宗病死。后以近江人三云资隆之子宗伯为养子。施药院宗伯的历代子孙担任施药院使的职务。
