丁元荐（1560年－1625年），字长孺，号慎所。明浙江承宣布政使司湖州府长兴县（今浙江省长兴县）人，曾在广东等地任职，历仕礼部、刑部，官至刑部检校、尚宝司少卿。事迹具《明史》本传。
丁元荐父丁应诏，本任江西佥事。丁元荐万历十四年（1586年）举进士，得第三甲。后丁父去世，以丁外艰请告归，在家居丧八年后，始谒选成为中书舍人。二十七年（1599年），京察，后又以丁内艰去职，居丧达十二年之久。万历三十八年（1610年），任广东按察司经历，后升按察司知事。翌年（1611年），再升礼部主客司主事。后移疾去。万历四十五年（1617年），因于党争被打垮而被削籍革职。天启四年（1624年），朝臣交讼其冤，后获起任刑部检校。同年后期，封尚宝司少卿。五年（1625年），朝事大变，再被朝廷削籍革职。同年不久去世，享年六十五岁。
丁元荐初举进士，即遭临丧父之痛，守孝达八年，后始谒选成为中书舍人。初居官，因见时政流弊，上书朝廷以万言书，痛陈时弊，主要抨击“今日事势可寒心者三”：“饥民思乱也，武备积弛也，日本封贡也。”、叹息时政七事：“征敛苛急也，赏罚不明也，忠贤废锢也，辅臣妒嫉也，议论滋多也，士习败坏也，褒功恤忠未备也。”，以及“坐视而不可救药者”二事：“纪纲、人心也。”丁实则专批曾为丁的座主，当时正任首辅的王锡爵。
万历二十七年（1599年），适逢京察内计。不久丁母去世，丁服丧十二年。三十八年（1610年），复任广东按察司经历，升按察司知事，再移礼部主事。刚上任礼部主事之时，又正值辛亥京察（1611年）。时有东林党争，官僚乘机徇私毁誉，结援同党。当时任职吏部尚书的孙丕扬扬言会力清“邪党”（宣党、崑党、楚党、齐党、浙党等），但后反为众朋党集团所攻击。时副都御史许弘纲又与孙共同掌管京察事务，眼见党争为祸，因而恐惧诸党威胁，数年间累上疏要求重新进行京察。朋党各部故以为孙丕扬领东林党人直疏其非，要求重核，又群起而攻击孙。《明史》提到当时党争的情境为：“察疏犹未下，人情杌陧，虑事中变，然无敢言者。”可见朝廷已四分五裂。这时丁元荐见状，上疏许弘纲不应因恐惧诸党势力而不敢直议，于是丁遭众党暗批发状，兼与部分朋党成员交恶。丁其后再上疏，欲辨晰事件，但不成功。其后党争愈加激烈，朝中正臣几乎被打垮殆尽，主要因为朋党以东林党人筹办之乡试，乃“六经乱天下”之由而上诉得直。丁此时正居家，闻党争互责互批之说，更甚恼怒，于是再次严词上疏，“极诋乱政之叛高皇，邪说之叛孔子者”。这份奏疏当然不被接纳，其他朋党成员亦与丁交恶日深。万历四十五年（1617年），丁巳京察，丁元荐因朝中朋党互相侵迫相害，被削籍革职。
天启初年，有朝臣大起遗逸，当中不乏东林党人，丁亦在遗逸之列，但丁独“格于例”，不参与召见。天启四年（1624年），朝臣交讼丁之于党争之冤情，再起任刑部检校，历任尚宝司少卿。但短短一年后，天启五年（1625年），又因朝事大变，被朝廷再次削籍革职。
丁被削籍后，始终因东林党争而继续被朝臣抹黑、弹劾。后学于许孚远，学成后又与顾宪成同游。丁通籍满四十年之时，前后服官亦未达一载，曾与邵沈㴶同邀入阁，但两人亦谢却不见丁曾拜访高攀龙，高亦有力劝丁入阁，但丁始终辞却所请，道：“吾老矣，不能涉嫌要津。”语后匆忙而去。丁后于天启五年去世，享年六十五岁。
《明史》载丁道：“慷慨负气，遇事奋前，屡踬无少挫。”以显丁氏于党争中，以及被党人打垮后，依然持守气节，亦辞却所有邀官之请。
实则丁元荐历仕多年，以东林党争对其仕途窒碍最大。其中两次京察，均被党人承机毁誉，终被朝廷两度削籍。晚年的丁元荐因而对任官心倦，多次辞却东林党人重任官职之请。据《明史》本传终句载，东林党争祸害，主要因东林党及浙党相互交恶。直至丁元荐临行将就木之时，浙党所弹射的东林党人中，就以李三才、丁元荐及于玉立最为盛，死后依然被人一直毁誉，党争于明神宗在任之时始终无日无之。
丁有着《赤水玄珠序》、《西山日记》二卷、《尊拙堂文集》十二卷、《程朱道命录》，以及《名山言海印谱》二卷。
