孙时芳（1564年－1647年），字中宇，绍兴山阴人，明朝、南明政治人物。
最初孙时芳获荐举为广东盐课提举，天启改任唐王府长史。当时时唐王朱硕熿年老，世孙朱聿键尚未请封，他就向朱硕熿三次上启让朱聿键于玉牒正名，最后成功，朱聿键也袭封唐王。之后朱聿键派人召来孙时芳，但他却请求辞官；到弘光元年（1645年）五月清军攻陷南京，朱聿键在福建即帝位是为隆武帝，其时再次起用他，八十二岁的他吩咐家人整理行装至福京谒见隆武帝。隆武帝看到他很高兴，点蜡烛迎接他，和他追述往事，并对内阁辅臣说：“以前孙时芳是朝廷的臣子，现在他则是朕的旧臣，才知道他的优异。现在商议让他担任尚宝少卿，未合乎朕的心意。”孙时芳回答：“臣子随时随地都能贡献自己，怎敢立志求爵位与俸禄？”隆武帝回应：“收复孝陵时再加恩也不迟。”于是让他担任尚宝司卿联络浙江和南直隶。仙霞关失守，孙时芳痛哭大叫：“谁令天下事到此地步！皇上还健在吗？”日夜大号小呼，隐居半年后呕血数斗而逝世，虚岁八十四。
