士族叛乱是日本明治初期旧武士阶级（士族）对明治政府的一连串反政府活动。
明治政府采取四民平等政策，废止大名・武士阶级，创设华族・士族。秩禄处分后，撤废俸禄（家禄）制度。施行废刀令等，废除身份的特权。此外，文明开化、殖产兴业政策和征韩论所引发的政争，演变成明治六年政变，导致西乡隆盛、江藤新平、板垣退助等人下野，都对士族阶级带来影响，这些反对明治政府的士族被称为“不平士族”。
明治7年（1874年）江藤新平、岛义勇在故乡佐贺县领导的佐贺之乱，明治9年（1876年）熊本县的神风连之乱，与神风连相呼应的福冈县秋月藩士宫崎车之助为首的秋月之乱，同年10月山口县前原一诚等人的萩之乱等反乱相继发生，但皆被政府军镇压。明治10年（1877年）鹿儿岛县萨摩士族拥立西乡，爆发最大规模的士族反乱西南战争，也已失败告终。
西南战争之后，不平士族的反对运动转变为主张国会开设、宪法制定的自由民权运动。
由明治六年政变下野的征韩党人江藤新平和忧国党的岛义勇带领11000人的不平士族在佐贺县发动的一场士族反乱，发生在1874年2月1日至1874年3月1日。只经历一个月，就比由大久保利通带领下的新政府官军平定。
由通称神风连的敬神党约170人的不平士族发动的一场士族反乱，发生在1876年10月24日的熊本县。只经历1天就被儿玉源太郎的官军完全镇压，神风连中124人战死，约50人被捕；官军方面约60名士兵阵亡，超过200人受伤。
由原秋月藩士宫崎车之助在福冈县发动的一场士族反乱，发生在1876年10月27日至同年11月14日，与神风连的士族反乱互相呼应。约有230－240人参加，甚至有说超过400人参加叛乱，被长州名将、人称“军神”的乃木希典平定。
由自称“殉国军”200多人的不平士族发动的一场士族反乱，领导人物是原长州藩士前原一诚。发生在1876年10月28日至同年12月8日的山口县，被同样也是原长州藩士的三浦梧楼为首的新政府军镇压。
“维新三杰”之一的西乡隆盛，在明治六年政变下野后返回乡下鹿儿岛县（萨摩）。回乡后开设专门培训士族的“私学校”，上至县知事、下至一些普通警察也是该校学生。全县依旧实行旧制，不理明治新政府的命令，等同独立国家。1877年明治新政府决定夺回鹿儿岛县的控制权，派官兵搬走鹿儿岛县内的军火，被士族学生发现并武力攻击官兵打算夺回军火，官兵拘捕多个士族学生。西乡隆盛救回士族学生，由于夺取军火等同宣战，西乡被迫带领“私学校”的士族学生叛乱，旧萨摩藩士和九州各地的士族亦支持西乡向明治新政府宣战。最终西乡军团不敌有栖川宫炽仁亲王为首的官军而战败（主要原因是官军使用的新式武器比起西乡军团的武器先进），西乡隆盛本人亦切腹自杀。西南战争中证明士族不一定比农民子弟兵优胜，所以没有士族再敢叛乱，此战为最后一次士族反乱。
