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2月13日，出现全国首宗死亡个案，为住在神奈川县的80余岁日本女性（#27），死因列作肺炎，死后确诊。
2月26日，公布再多2宗死亡个案，死亡个案增至3宗。其中一人（#154）是有高血压的北海道函馆市高龄者，25日不治，死因列作病毒性肺炎，翌日确诊感染武汉肺炎；北海道首宗死亡个案。另一人（#56）是有糖尿病的东京都的80余岁男性，18日确诊，26日不治，死因列作肺炎；东京都首宗死亡个案。
2月27日，公布再多1宗死亡个案，死亡个案增至4宗。死者（#99）是住在北海道知内町的80余岁男性，有心脏及慢性阻塞性肺病等基础疾病，22日确诊，27日不治。
2月28日，公布再多1宗死亡个案，死亡个案增至5宗。死者（#31）是住在和歌山县的70余岁男性农民，13日确诊；2月22日及24日病毒检测呈阴性，28日不治。和歌山县首宗死亡个案。
