查继佐（1601年－1676年），初名继佑，初字三秀，更字友三，号伊璜，又号与斋，别号东山钓史、钓玉。浙江海宁人，明末清初学者。
查继佐为查尔翰之子，生于明万历二十九年（1601年）七月四日。家贫多病，崇祯六年（1633年）中举人。明亡后，随鲁王监国绍兴，授兵部职方。在浙东地区亲自率军抗击清军。监国鲁元年（1646年）清军攻占绍兴，隐居海宁硖石东山万石窝，改号为左尹非人。监国鲁七年（1652年）于西湖觉觉堂讲学，旋至杭州铁冶岭之敬修堂讲学，从学者众，人称敬修先生。
康熙二年（1661年），卷入南浔庄廷鑨私刻《明史》案，列名参校，下狱论死，后因提早自首而免罪，与范骧、陆圻等三人皆获救。遂纵情声色。晚年喜写梅，于清康熙十五年元月二十日戌时去世，年七十六。
著有《罪惟录》、《国寿录》、《鲁春秋》、《东山国语》、《班汉史沦》、《续西厢》等。
有证据显示查继佐是《明史》案检举者。道光以后人陈康祺于《郎潜纪闻》中推断查继佐应负主要责任，实在是违背“虎兕出于柙，龟玉毁于椟”，则守土者不得推诿其过的原理。清初谷应泰《明史纪事本末》对其记载则略为平恕公允。当事人陆圻的女儿陆莘行则提到其父等三人曾向学官自首。《范氏记私史事》一书提到周亮工劝另一位当事人范骧检举明史案一事：“刻书列参评常事也，曷以知其祸而检举焉。得故周栎园先生语余父曰偶见庄氏书，载闯逆入宫有禅表，下注龚鼎孳手笔。且言合肥（龚鼎孳）慕大范老子久以未获一识为恨事，望速检举日后好相见也。但为首查某为人反复勿使知可耳。”
传言查继佐曾济助发迹前的吴六奇，后者因此在案发后营救前者，但是真实情况却并非如此。《查继佐年谱》里，查继佐本人亦否认有此事，说：“葛如，方布衣野走，世传余有一饭之恩，怀之而思报。其实无是也。是则公在时已传其事，故公为之辨。”乾隆时诗论家吴骞也认为此传闻事不可靠。
