南企仲(1561年-1643年),字伯墀,号弦蒲,陕西渭南人,晚明政治人物,同进士出身。
绍兴府知府南大吉之孙。陕西乡试第四名,后参加会试第二百二十三名。万历八年(1580年)登进士第三甲第二百一十八名。以祖母年纪大为由,请求回乡奉养祖母。后授刑部主事,擢太仆寺少卿,进太仆寺卿。万历三十年(1602年)直谏免除矿税,因而得罪明神宗,被削籍归乡,天启初年(1621年)重起为太常寺卿。崇祯初年(1628年)官至南京吏部尚书。崇祯十六年(1643年)李自成军队攻破渭南,南企仲年过八旬,大骂不屈,绝食两日而死。其子居业、族子居益俱绝食而死。
曾祖父南金,曾任教谕,赠户部郎中、祖父南大吉,曾任知府、父亲南�。母武氏。