西门君遂（？－893年），为唐昭宗手下宦官，曾任神策军护军中尉、观军容使等职。
西门君遂原任于内侍省中，因行事机敏，受到唐昭宗喜爱，荣宠有加。
大顺二年九月八日（公元891年），在原观军容使杨复恭退休后接任其职。不久由于杨复恭义子杨守信、杨守厚、杨守亮等与天威都将李顺节爆发冲突，杨守信遭到指控与杨复恭阴谋叛变。
十月八日，唐昭宗上安喜楼，下诏天威都将李顺节和神策军使李守节，率军讨伐杨复恭。并任命西门君遂和宦官刘景宣分别为左右神策军护军中尉，参加讨伐行动。禁军围攻杨复恭家宅，杨复恭手下死士张绾率武士抵抗，竟不能攻克。加之杨守信率军赶到协防，遂先行撤离。
十月九日，驻含光门禁军原想趁乱洗劫长安街市，但被中书门下同平章事刘崇望说服，加入战斗，杨守信部队已无法支持，一哄而散。杨复恭与杨守信见状，乃携带家眷，从通化门撤出，逃奔兴元。永安都头权安追击，擒获张绾，将其斩首。杨复恭遂与杨守亮、杨守信、杨守忠、杨守贞、杨守厚等，以讨伐李顺节为名，一同反抗中央。
十二月十二日，西门君遂对骄横放纵的李顺节产生厌恶之心，遂与刘景宣用皇帝诏书，命李顺节进宫。李顺节到银台门，两人将其贴身卫士、随从请至禁军营舍休息，供奉官似知先（一说为刘景宣部将嗣光审）趁机从背后砍杀李顺节。其随从、卫士闻变，冲出延喜门，出外叫喊。天威、捧日、登封三特别营一齐叛变，劫掠永宁坊和长安街市，至下午，各营才恢复秩序，回归中央。
景福元年二月（公元892年），凤翔节度使李茂贞不断上奏要求中央任命他为招讨使，又写信给中书门下同平章事、太尉杜让能、神策军护军中尉西门君遂，信中内容多为轻蔑文辞。西门君遂私底下与王行瑜、李茂贞等节度使互通消息，却又将信内措辞告至昭宗，昭宗为之大怒，在给事中牛徽的劝阻下才平息怒火，任命李茂贞为山南西道招讨使。
李顺节死后，同为天威军使的贾德晟，对于前任长官李顺节冤死一事，多有怨言。西门君遂大为反感。
四月，西门君遂上疏弹劾贾德晟，指控其对朝廷“多有毁谤言语”，昭宗遂斩贾德晟，其部下千余骑逃奔凤翔，投靠李茂贞。
景福二年八月（公元893年），李茂贞上疏，抨击中央。昭宗愤怒若狂，召杜让能进宫议事，命杜让能就在中书省住下，一月有余，商讨如何讨伐李茂贞。
然行事不密，遭另一宰相，同为门下同章平事崔昭纬窃听。崔昭纬派人通知李茂贞，李茂贞命他的党徒千余人在京师发起示威，拦住观军容使西门君遂、门下同平章事崔昭纬、门下同平章事郑延昌三人坐骑和行轿，西门君遂将责任推卸给另两人，随后快速通过。郑延昌、崔昭纬声称并不知情，群众暴怒，投掷砖瓦，两人侥幸逃出一命。昭宗得知，命人诛杀示威领导者，同时下令覃王李嗣周为京西招讨使，神策大将军李鐬当副招讨使。
九月十日，行动开始，覃王李嗣周护送徐彦若至凤翔就任节度使，携带六万兵卒，李茂贞联合王行瑜，一同出兵反抗。
九月十七日，双方相遇，中央军未及交战，旋即溃散，望风而逃。李茂贞趁胜进军，京师人心惶惶，群众聚集，要求诛杀发动战争者。
九月十九日，李茂贞上疏列举杜让能罪行，要求昭宗诛杀杜让能。昭宗见疏，与杜让能泣：“与卿决矣！”。当日下诏贬杜让能为梧州刺史，群众仍不满意，再把观军容使西门君遂放逐至儋州、内枢密使李周潼流窜崖州、内枢密使段诩流窜驩州。
九月二十日，昭宗出安福门，再贬杜让能为雷州司户，西门君遂、李周潼、段诩三人遭斩首，昭宗向李茂贞解释战争主谋者乃此三人，试图拯救杜让能一命，然杜让能仍在十月被迫自尽。
