瓦片阵列

✍ dations ◷ 2025-10-03 17:23:27 #微阵列,计算生物学

瓦片阵列(英语:Tiling array,亦称为覆瓦阵列)是微阵列芯片中的一种子类型。类似于传统微阵列,瓦片阵列通过将标记的DNA或RNA靶分子杂交到固定在固体表面上的探针而发挥作用。

瓦片阵列与传统微阵列之间的不同之处在于探针的性质:瓦片阵列的探针并不是对散列在整个基因组中的已知或预测基因的序列进行探测,而是对连续区域内存在的已知序列进行密集地探测。这有助于表征已测序但功能却知之甚少的区域。瓦片阵列可用于:辅助转录物组作图、发现DNA/蛋白质相互作用(ChIP-chip和DamID)位点、DNA甲基化(MeDIP-chip)位点、DNA酶敏感(DNase Chip)位点及阵列比较基因组杂交。瓦片阵列除了可以检测之前未鉴定的基因及调控序列,还可能对转录产物进行深度定量。被称为“特征”的瓦片阵列单位中,特异性探针的拷贝数可上数百位(而在传统阵列中仅有少数几个),而密布在每张阵列上的特征数则在10,000到大于6,000,000个之多。可以通过调节探针与探针之间重叠的序列多少、探针序列间已知碱基的数量或探针长度而达到改变作图分辨率的目的。对于如拟南芥这样较小的基因组,瓦片阵列甚至可对全基因组进行探测。瓦片阵列是全基因组关联分析中应用的有力方法。

相关

  • 中耳炎中耳炎是一系列中耳发炎疾病之统称。其中以急性中耳炎(AOM)和中耳积水两型最为常见(OME)。急性中耳炎为急性感染所致,耳朵疼痛为其常见的临床症状。罹患急性中耳炎的幼童,常有拉扯
  • 苏格兰高地苏格兰高地(英语:Scottish Highlands;苏格兰盖尔语:A' Ghàidhealtachd;低地苏格兰语:Scots Hielands)是苏格兰高地边界断层以西和以北的山地的称呼。许多人将苏格兰高地称为是欧洲
  • 秋信守秋信守(朝鲜语:추신수/秋信守、Shin-Soo Choo,1982年7月13日-),在韩国昵称为“辣椒”(因球迷对秋信守欢呼时喊著“Go Choo!”的呼号,音似韩文的辣椒(고추)),出生于韩国的釜山广域市,现为
  • 四道场中国佛教四大名山,传说是四大菩萨的道场。浙江普陀山是观音菩萨的道场,山西五台山是文殊菩萨的道场,四川峨眉山是普贤菩萨的道场,安徽九华山为地藏菩萨道场。以上四处也合称“四
  • 阴茎异常勃起阴茎异常勃起(priapism)是一种不正常阴茎勃起状态,在这种状态下阴茎虽然没有受到与性欲相关的刺激,却无法自然恢复疲软状态。一般与性欲无关的勃起持续四小时即算是异常勃起,这个
  • 范德瓦耳斯方程范德华方程(van der Waals equation)(一译范德瓦耳斯方程),简称范氏方程,是荷兰物理学家范德华于1873年提出的一种实际气体状态方程。范氏方程是对理想气体状态方程的一种改进,特点
  • 秘鲁凉流洪堡凉流,也称秘鲁寒流,南太平洋东部凉流,是一个低盐度的洋流,沿南美洲西岸从智利南端伸延至秘鲁北部,于南纬10°以北偏向西行,构成南太平洋南赤道海流的补偿流。在北端可伸延至离
  • 金怀玉金怀玉,江南江都人。清朝政治人物,进士出身。顺治十五年(1658年)戊戌科进士。康熙元年,任泉州府推官。为民所想,受到百姓爱戴。
  • 钱千里钱千里(1915年3月-2009年7月31日),江苏南通人,中国电影导演、演员。被称为“中国电影活档案”。2009年获中国电影金凤凰奖特别荣誉奖。
  • 迈克尔·杜卡基思迈克尔·斯坦利·杜卡基斯(英语:Michael Stanley Dukakis,1933年11月3日-),美国政治家,马萨诸塞州人,曾于1975年-1979年,及1983年-1989年间担任马萨诸塞州州长,是马萨诸塞州在任时间最