水生昆虫（英语：Aquatic insect）俗称“水虫”，目前全球已知的昆虫达100多万种，其中约30,000多种昆虫（分属13个目）的一个或多个生活史阶段在水中生活或与水体有关，它们统称为“水生昆虫”。其中蜉蝣目、裱翅目与毛翅目对水质敏感，常用于水质生物监测。
水生昆虫可分为水生和半水生两大类。
按传统的昆虫分类系统，有翅亚纲的“水生昆虫”可分为外翅部和内翅部。外翅部的类群有蜉蝣目、祯翅目、蜻蜓目、半翅目（划蝽科、仰蝽科、黾蝽科、蝎蝽科等）和（直翅目(蚤蝼科）； 内翅部的类群有毛翅目、长翅目、广翅目、脉翅目（水蛉科）、膜翅目（潜水姬蜂科）、鳞翅目（水螟亚科）、鞘翅目（龙虱科、豉甲科、两栖甲科等）和双翅目（蚊科、摇蚊科、蚋科等）。无翅亚纲的水生昆虫仅有现已分类为内口纲的弹尾目。
