Y RNA

Y RNA系一种短非编码RNA。它是Ro60核糖核蛋白颗粒的组分之一。在全身性红斑狼疮患者体内，它是患者自身抗体的攻击目标之一。Y RNA对DNA复制来说至关重要，因为它们能与染色质和起始点识别复合物相互作用。推测Y RNA的5'和3'端会折叠形成一个保守的茎形结构。已确认Y RNA有一个单胞嘧啶（C）突出，这个突出对Y RNA与Ro蛋白的结合至关重要。目前，已知Y RNA有两大功能：一，抑制Ro60；二，作为DNA复制的一种起始因子。失去了保守的与Ro60蛋白的结合位点的突变人类Y RNA仍然能参与DNA复制，这说明与Ro蛋白结合以及启动DNA复制是Y RNA的两种互不相干的功能。尽管Y RNA的衍生小型RNA大小与微RNA相当，但是它们却和微RNA在功能上却毫无关系。在自由状态下，Ro蛋白质会与一系列的折叠错误的RNA结合，比如折叠错误的5SrRNA，这被认为是（RNA）品质控制机制的一种。与Y RNA或另外的RNA结合的Ro复合物的晶体结构显示，Ro蛋白质与单链RNA的3'端的结合特异性相对较低。但Y RNA与Ro蛋白质还会在另一位点发生特异性结合，且该结合能调控Ro复合物与其他RNA的结合。在Deinococcus（英语：Deinococcus）中，自由状态下的Ro蛋白亦与参与23SrRNA的成熟过程。在该物种中，造成Y RNA缺失的突变并不致死，Y RNA在不与Ro蛋白结合时会不稳定。人类的Y RNA对DNA复制是不可或缺的。通过生物化学上的分离和重构实验，人们已证明，在体外培养（in vitro）的脊椎动物细胞的核中，Y RNA对染色体DNA的复制是必不可少的。如果对体外细胞或体内（in vivo）细胞中的Y RNA进行特异性降解的话，那么DNA复制会被抑制。科学家认为Y RNA通过作同时与染色质和与复制启动相关的蛋白（包括起始识别复合体）结合的中间体发挥作用。Y RNA在一些人类肿瘤中处于过度表达状态，且为细胞增殖所必需。Y染色体的与微RNA大小相近的小型分解产物可能与自体免疫病等病症有关。已在真核细胞与细菌中发现了被推定为Y RNA和Ro蛋白质的物质。人类应有4种Y RNA，分别是hY1、hY3、hY4，以及hY5。另外，人体内也有很多与Y RNA相关的假基因。秀丽隐杆线虫（C. elegans）则有1种Y RNA，名为CeY RNA。该生物体内许多sbRNA（英语：sbRNA）也被认为可能与Y RNA同源。抗辐射奇异球菌（Deinococcus radiodurans）编码一种与Ro蛋白同源的蛋白质，名为rsr（Ro sixty related，意为第六个与Ro有关的）。用UV灯对该菌进行照射，可以诱导编码rsr的基因的表达。在该情况下，抗辐射奇异球菌的菌体内至少会出现4种短RNA，其中一种RNA似乎与Y RNA具有同源性。