孙昌裔（1565年－？年），字子长，号凤林，福建福州府闽县人，明朝政治人物。
嘉靖四十四年（1565年）出生。万历三十一年（1603年）癸卯科举人，三十八年庚戌科第三甲第五十三名进士。授都察院观政，本年改浙江湖州府教授，四十一年升国子监学正，四十三年升户部浙江司主事，榷浒墅钞关，擢户部郎中，出守杭州府，天启二年（1622年）二月举卓异，赐宴礼部，升为本省按察司副使，管屯田水利，五月寻改提督浙江学政，得人为盛，有求不获者，从中中伤之，昌裔即治装归。卒于崇祯末年。
父孙承谟，官崇德知县。
从弟孙昌祖举天启四年甲子举人，以闱策刺魏珰，罚停会试三科，与艾南英、谢于道、程科会三人，诏颁名天下，以禁闱中之讥讪朝政者。庚辰成进士，任嘉兴府推官，以仁明称。
子孙学稼，潜心稽古，不求荣进，著有《兰雪轩草》。
