百济王氏是日本古代的一个氏族，其祖先是百济末代国王义慈的儿子百济王善光。
在7世纪中期，唐朝与新罗结盟，百济则与倭国结盟，以对抗唐朝和新罗的势力。义慈王将自己的儿子丰璋和禅广（又称善光）送往倭国做人质。660年，百济为唐朝、新罗联军所灭。倭国立丰璋为百济王，并送丰璋归国即位。然而倭国、百济联军在白村江战败，丰璋被俘流放岭南。百济复国的梦想就此破灭，不少百济人选择流亡倭国。
扶余义慈的儿子善光作为唯一一个在倭国的百济王子，于664年得到了天智天皇的允许，在摄津国难波一带附近建立百济郡（今大阪市天王寺区东部），以统治百济的遗民。691年，又被持统天皇赐予“百济王”的氏，这就是百济王氏的起源。
百济王氏出身的历史人物有：为日本向东北开疆拓土作出贡献的百济王俊哲（陆奥镇守将军征夷副使）；担任从三位刑部卿的百济王敬福；担任出羽守的百济王武镜；以及桓武天皇的女御教法、后宫教仁；嵯峨天皇的女御贵命和尚侍庆命等。
今大阪府枚方市存在着一个百济王神社，是百济王氏祭祀祖灵的神社。今神社内祭祀著百济王神和进雄命。
