，驱使印加人到银矿劳动。
西班牙人到来，对南美原住民有极大的负面影响。印加人的人口下跌速度，比其他美洲原住民的人口下跌速度更加快。学者估计，印加人口下跌速度最高的中安第斯山脉地区，在1520年至1571年间，人口下跌比率达到54:1。
疾病是造成人口下跌的主要原因。西方人在不知不觉之间，将旧世界的疾病带到新世界。疾病对原住民所造成的打击，比战争所造成的打击深重。印加并没有阿兹特克、玛雅那样的书写传统，所以学者很难估计人口下跌的数字，也无从得知西班牙人到来后所发生的事件。不过，疾病显然在西班牙人进入印加地区之前，就开始蔓延了。出血性天花在1524年就进入了安第斯山脉地区。西班牙人的文献显示，疾病重创了原住民，导致原住民无力反抗。学界对16世纪20年代所出现的疾病，是否天花，仍然存在争议。一小部分学者认为，当时蔓延的疾病并非外来的天花，而是南美本土的卡里翁氏病。N. D. Cook在1981年发表的研究中声称，安第斯山脉的原住民的人口，在殖民时期遭三次单独下跌。第一次爆发的是天花，导致30%-50%的人病死。第二次爆发的是痳疹，又导致25%-30%的人病死。最后，天花和痳疹一起爆发，导致30%-60%的人病死。在三次爆发中病死的人，占原先人口的93%。
除此之外，西班牙人奴役、抢掠、破坏也造成了一定的人口下降。西班牙士兵强掳了成千土著女性。西班牙文献显示，土著是自愿成为仆从的。不过，有学者认为，这些人是受到死亡威胁后，才被迫成为仆从的。土著如果屈从西班牙人，为西班牙人劳动，就可以得到安全，如果进行抵抗，就会被西班牙人消灭。
西班牙人征服印加的另一个重要影响是使得基督宗教传入南美。很多土著被迫放弃原有信仰，改信“唯一的真正宗教”。西班牙传教士在印加帝国毁灭后，能够自由无阻地行动传播福音。整个大陆在一代人的时间内，就受到了基督教影响。
