秘阁，是中国宫廷藏书之处，自晋、南朝宋至隋、唐，皆设有秘阁藏书，宋沿唐制设三馆，改弘文馆为昭文馆。北宋太宗太平兴国年间新建昭文馆、集贤院、史馆等三馆收藏图籍，总名为崇文院，通称阁职。端拱元年（988年）又於崇文院中堂设秘阁，选三馆善本图书及书画等入藏，藏书最为完备。淳化元年（990年）扩建秘阁，于淳化三年（992年）建成，宋太宗御题匾额“秘阁”，设直秘阁、秘阁校理等官管理秘阁事务。真宗咸平三年（1000年），下诏向全国征集三馆所少图书，献一卷，给千钱，献三百卷以上给出身。又令三馆抄写二套，一套放置禁中龙图阁，一置后苑之太清楼。后宫中失火，延烧到崇文院与秘阁，其中藏书多有焚毁。于是出禁中本，重新校勘、校理，恢复秘阁藏书，至仁宗时，秘阁归属秘书省管理，藏书已达15785卷。
仁宗景祐元年（1034年）命翰林学士张观、李淑、宋祁等校定整理三馆与秘阁藏书，去芜存菁、刊其讹舛，编成书目，赐名“崇文总目”，历七年至庆历元年七月成书，庆历元年（1041年）十二月，翰林学士王尧臣、王洙、欧阳脩等上“新崇文总目”六十卷，是中国现存最早的一部国家书目（已残缺）。宋朝崇文三馆和秘阁曾多次失火，补缺端靠“崇文总目”。据江辟疆“目录学研究”统计，宋代官修藏书目录达15种左右，远胜于其他朝代。徽宗时因三馆书多遗缺，募员缮写一式三份，一份藏于宣和殿，一份藏于太清楼，一份藏于秘阁。靖康之变时，金兵攻陷汴梁（今开封），宣和馆阁藏书与二帝皆被劫送北都。康王赵构南渡在临安即位后，下诏搜求各地藏书，重建秘阁。
Huiping Pang 彭慧萍, “Liangsong gongtingshuhua chucangzhidu zhibian: yi Mige wei hexin zhi jiancang jizhiyanjiu” 两宋宫廷书画储藏制度之变：以秘阁为核心之鉴藏机制研究 , Gugong Bowuyuan Yuankan , 1 (2005), 12-40.
Huiping Pang 彭慧萍, “Cunshi shuhua suoqian Shangshushengyin kao” 存世书画所钤尚书省印考 , Wenwu , 11 (2008), 77-93.
Huiping Pang, “Shangshushengyin zhi yanjiuhuigu ji wuxiang shangque” 尚书省印之研究回顾暨五项商榷 , Gugong Bowuyuan Yuankan 故宫博物院院刊 , 1 (2009), 44-59.
