日本驻重庆总领事馆(日语:在重慶日本国総領事館、英语:Consulate-General of Japan in Chongqing)是日本在重庆设立的处理侨民及领事事务的官方外交机构。
1998年3月前身日本驻华大使馆重庆事务所成立,2005年1月1日日本驻重庆总领事馆正式开馆,位于重庆市渝中区邹容路68号大都会商厦37楼。2019年3月渡边信之担任总领事。。
坐标:29°33′29″N 106°34′46″E / 29.55806°N 106.57944°E / 29.55806; 106.57944