曹允源(1856年-1927年),江苏省苏州府吴县人,祖籍安徽歙县。清朝政治人物、进士出身。
光绪十五年(1889年),参加光绪己丑科殿试,登进士二甲44名。同年五月,著主事,分部学习。
民国时期曾任江苏省立图书馆馆长。