吴子骐（16世纪－1647年），字九逵，贵阳府新贵县人，明朝、南明政治与军事人物。
吴子骐是万历四十年（1612年）的举人，获授兴宁知县，安邦彦作乱包围贵阳，他顾念母亲而仓皇弃官归乡，因此不再出仕；崇祯十年（1637年）土蛮阿乌谜反叛，朱燮元命令他带着诏书召集各部酋长，晓以利害，使各土著相继降附朝廷，朱燮元上表他的功劳，得到玺书褒奖。孙可望领兵攻至，吴子骐和刘琯、杨元瀛、郭忠懿、李公门、李世甲、丘洪率领乡兵扼守要道遭打败被擒，与王孙齐及贡生蔡绍周，诸生马士升、胡修超共同不屈而死，他的妾侍骐朱氏也上吊自杀。
