郑怀魁（1563年－1612年），字辂思，福建龙溪县人，明朝政治人物。
万历二十三年（1595年）乙未科进士。三十一年春，补户部河南司郎中，不久，掌大司农籍牍出入。他透过礼部得知利玛窦。万历三十一年，李之藻在福建乡试出一道“天文”试题，引起郑怀魁兴趣。万历三十三年京察，郑怀魁迁知处州，接下来的一年里，李之藻在山东张秋治河，期间完成《浑盖通宪图说》，并于万历三十五年请郑怀魁帮忙出版。郑怀魁再将刊刻之事交由丽水知县樊良枢处理。曾在漳州与张燮结霞中诗社，盛况空前，与会者可达百人。曹学佺即于万历三十一年（1603年）应郑怀魁之请，加入他们的活动。与张燮、蒋孟育、高克正等合称“七子”。
工诗，有《葵圃集》30卷等。
