对微软的批评围绕着其产品和商业运作等各个方面。软件的易用性、稳定性以及软件安全问题是受到批评的共同目标。踏入21世纪，Microsoft Windows和其他程序的安全漏洞成了一些恶意软件事故中的目标。微软还被指责在产品中锁定销售商和消费者，软件没有遵循现行标准。Linux和Windows的总体拥有成本比较也是长期的争议点。
公司一直是政府和其他企业众多反垄断诉讼的中心。2004年，欧盟裁定微软在欧盟微软竞争案中罪名成立。此外，Microsoft程序的最终用户许可协议经常被批评过于严格。
2014年9月23日，微软宣布将自家旗下的网络硬盘OneDrive的免费用户永久存储空间上调至15GB，如果用户使用OneDrive备份照片则可再获得15GB奖励。2014年10月28日，微软宣布为所有Office 365订阅用户提供无限云存储服务。然而，在2015年11月3日，又宣布因为部分用户存在滥用问题，将在2016年取消为Office 365订阅用户提供无限云存储服务的计划。Office 365订阅用户的云存储空间将变为1TB，免费用户的云存储空间（包括先前的老用户奖励和上传照片奖励的空间）则一律降低至5GB。此举引起Onedrive用户的不满。2015年12月12日，在收到累计超过7万名用户的抗议后，微软做出妥协。所有在2016年前注册的用户在登陆微软指定的网站登记，登记后就可以保持免费存储容量不变。但没有登记的用户和2015年12月31后新注册的用户的免费空间都会缩减到5GB，Office365的订阅用户也不能继续保持无限存储空间。
微软在2014年9月承诺允许所有的Windows Phone 8设备免费升级至Windows 10 Mobile，但是在2016年3月17日反悔，宣称只有18台Windows Phone 8.1设备可以升级至Windows 10 Mobile，参与预览体验计划预先升级至Windows 10 Mobile的设备一律处于不受支持状态，此举引发了参与预览体验计划的用户和Windows Phone用户的不满。
