少年宫站是深圳地铁4号线和3号线的换乘站。地处市民中心后花园,位于莲花山的南侧。该站主体位于中国广东省深圳市福田区红荔路与鹏城四路的交汇路口的地下,3号线车站在红荔路道路下面,沿红荔路呈东西走向;4号线车站在鹏城四路道路下面,沿鹏城四路呈南北走向,车站的南北方向位于红荔路与福中一路之间,车站的东侧是深圳少年宫,西侧是深圳书城中心城,4号线站台位于深圳市中心区中轴线以东。少年宫站在2011年清湖站启用以前,是4号线北面总站。在2010年12月28日深圳地铁3号线通车前亦曾为深圳地铁系统中最北的车站(被双龙站取代)。
少年宫站4号线站台的结构共分二层,其中两个同一水平的侧式站台设于下层,而上层则为车站站厅,在站厅可通过一个130米的转线通道(中间设有扶手带)来换乘3号线,3号线和4号线的站厅相互独立,其中4号线站厅连接A至D出口,而3号线站厅连接E至F出口。和大剧院站不同,乘客不可在车站内的非付费区来往两个站厅。车站并设有四条轨道。其中4号线南端及北端,分别设有单渡线及存车线,可供4号线列车进行站前或站后折返。当4号线北段出现故障时,往清湖站的列车将会通过此渡线或存车线折返,以本站为临时总站,2011年6月16日前本站仍为4号线尽头站时便使用该渡线折返4号线列车。
乘客换乘另一线路,需先乘搭滚梯或垂直升降电梯前往站厅,再经换乘通道前往另一线路的站厅,然后从站厅前往站台。换乘通道内设有双向的扶手带,以方便换乘,这种设施是首次在深圳地铁中出现。
少年宫站共设有8个出口。
作为深圳地铁一期工程的一部分,少年宫站在2004年12月28日启用。车站建设时,该站曾以文化中心站为名。少年宫站在2011年清湖站启用以前,是4号线北面总站。