马耳他总理（Prime Minister of Malta） (马耳他语：Prim Ministru ta' Malta)是马耳他的政府首脑。由马耳他议会选举产生。
1921年马耳他自治政府成立，其首脑称为首席部长(Head of Ministry)，期间职务因宪法被中止而被撤销两次。第一届(1930 - 33)部长首脑(当时为杰拉尔德·斯特里克兰)和他的内阁被保留，在1934年后第二届内阁被英国殖民政府驳回。
1936年宪法被废除，马耳他由英国殖民政府直接领导。1947年，英国允许马耳他成立自治政府，而仍然保留其殖民地位，保罗·博法出任首任自治政府总理。但随后在1958年撤销自治政府。
1964年9月21日马耳他正式宣布独立，为英联邦成员国。1974年12月13日修改宪法，正式成立马耳他共和国。
马耳他议会实行一院制，称众议院。议会经普选产生执政党和在野党，由执政党组成政府。1998年9月马耳他国民党在大选中获得胜利，埃迪·芬内克·阿达米组成新一届国民党政府。2003年4月15日，国民党连任，2004年3月，阿达米辞职后，劳伦斯·冈奇(Hon.Dr.Lawrence Gonzi)接任总理兼财政部长，并对内阁进行调整。
总理府(总理办公室，简称OPM)自1972年以来位于瓦莱塔的奥伯吉城堡(Auberge de Castille)，是政府的行政总部，核心部门包括内阁秘书处(OPM)、管理和人员办公室、信息部门和马耳他武装部队(AFM)总部。目前，有在OPM超过300名公务员，不包括约1500人的AFM员工。
1921年马耳他政府成立以来有12人担任总理，1933年至1947年以及1958年和1962年期间这个职务没有存在，
