陈辉祖（？－1783年），清代湖南祁阳人。
两广总督陈大受之子。乾隆二十年（1755年），以荫生授户部员外郎，后迁郎中。乾隆三十四年（1769年）十二月，任广西巡抚，乾隆三十五年（1770年），请修灵渠；乾隆三十六年（1771年）九月，任湖北巡抚；官至闽浙总督。乾隆四十六年七月，奉命查抄甘肃冒赈案事主王亶望的家产，以四、五万两白银盗换了价值九万余两的黄金，隐藏玉器，将贵重器物多占为己有。乾隆四十八年（1783年）二月，被赐死。 著有《陈辉祖奏稿》。
其弟陈严祖在甘肃冒赈案中被处死。
陈辉祖本受乾隆器重，承办王亶望贪污案，惜因办案过程中目睹王贪污巨款甚多，顿起贪念占为己有，乃衍生出案外案，中饱私囊，被发觉得原因是，王亶望曾经向乾隆进贡过一批玉器，乾隆帝不收，但心中有残念，于是在清单上寻找这些物品，但未曾发现，于是得知陈辉祖又从中贪污，乾隆非常伤心陈辉祖的欺君及不自检点，原判斩监候，后令其在狱中自尽。
