墨顿学院（英语：Merton College, Oxford）位于牛津市墨顿街，是牛津大学最古老的学院之一。学院于1264年建立，以悠久的历史、出色的学术著称。
墨顿学院的创立可以追溯到1264年，时任英格兰大法官（Lord Chancellor）的W·墨顿（Walter de Merton）决定创立一个独立的学术组织并设立基金会、制定相关条例，这也就是墨顿学院的雏形。这一条例的特点在于，规定墨顿学院是自治的，资金也由院长和院士们直接支配，这正是今天牛津大学多数独立学院的特点。正因如此，墨顿学院宣称自己是牛津大学最古老的学院。
1274年，墨顿从皇室职位退休，全身心投入学院的建设中。他对学院条例做了最后的修改，并在牛津城的东南角开始兴建学院建筑。到13世纪末，餐厅、教堂以及学院前庭（Front Quad）的其他部分都顺利完工。700多年来，这里的学术活动一直延续，学院的建筑也不断扩展。时至今日，墨顿学院已成为牛津大学学术实力最强、最富有的学院之一。
