《火焰之纹章 纹章之谜》（日语：ファイアーエムブレム 紋章の謎）是一款由Intelligent Systems制作、任天堂发行的战略角色扮演游戏，适用于超级任天堂平台上。这款游戏是火焰之纹章系列的第三款作品，同时是首款发行于超级任天堂的作品。游戏故事分为前后两篇，前篇“第1部：暗黑战争篇～暗黑龙与光之剑”为系列首作《火焰之纹章 暗黑龙与光之剑》的复刻版，而后篇“第2部：英雄战争篇～纹章之谜”则是接续前篇故事情节的新作。故事讲述邪恶祭司卡涅夫及暗黑龙梅迪乌斯被击败后，阿卡奈亚大陆恢复了和平，而王子马尔斯则着手重建他的祖国阿利提亚王国。另一方面，马尔斯的盟友哈丁坐上了阿卡奈亚的王座后却开始进行一连串的军事扩张，迫使马尔斯对抗他的老朋友和其部队。游戏玩法遵循系列传统，每场战斗都在网格状地图上进行。
《火焰之纹章 纹章之谜》的开发工作始于1992年，而当时Intelligent Systems正开发《火焰之纹章外传》。曾参与前作开发的工作人员（包括系列创作者加贺昭三及作曲家辻横由佳）继续担任相同职位。尽管开发团队在初期把《暗黑龙与光之剑》的复刻版及纹章之谜构想为两个单独的项目，但最终他们把两者合并起来。游戏系统及玩法抛弃了前作《外传》所作出的改变，并用回原本的设定。同时，开发团队降低了游戏难度，以鼓励新玩家接触此游戏系列。
《火焰之纹章 纹章之谜》于1994年1月21日发售，其游戏玩法的改进及技术品质获得了游戏评论家的正面评价。本作发售后创下了系列首周销量的最高纪录，直至2012年才被《火焰之纹章 觉醒》打破。而截至2002年，游戏录得约776,338份的销量，是当时系列销量最高的作品。本作的衍生作品《BS火焰之纹章 阿卡内亚战记》于1997年发行。另外，本作重制版《火焰之纹章 新·纹章之谜 ～光与影的英雄～》于2010年在任天堂DS平台上推出。2017年，任天堂推出迷你超级任天堂，而本作则作为其中一款内置游戏重新在日本发行。
《火焰之纹章 纹章之谜》是一款战略角色扮演游戏，玩家会扮演《暗黑龙与光之剑》的主角马尔斯，并率领他的军队在阿卡奈亚大陆各处执行任务。在每场战斗之间，角色们会在过场动画内互相交谈，从而推动故事的发展。游戏内的每场战斗都在网格状地图上进行，而每张地图都有着独特的地形，例如山脉、河流、平原及森林。战斗系统采用回合制，以玩家单位、敌方单位及盟军单位的排序进行。每一章节都有不同的胜利条件，包括清除所有敌人，或是镇压敌方某个特定据点。在本作中，角色的武器字段及道具字段是分开的，因此每个角色能最多持有四把武器及四件物品。另外，每个角色单位都有所属的兵种，而该兵种则决定了角色能使用的武器种类、攻击范围及移动距离等。骑乘系角色可以选择下马，但此举会改变角色的属性及能力值，同时减少其移动范围。但在部分室内地图内，骑乘系角色则必须强制下马，使他们成为在室内地图内唯一使用长枪作武器的单位。游戏中新增舞娘职业，她可以让一个单位在一回合内行动两次，而这个职业也成为了后来的火焰之纹章系列游戏中不可缺少的一个职业。
当战斗开始时，屏幕上会出现一个单独的画面来显示战斗状况。角色的攻击力取决于其力量及装备之武器，而伤害则根据攻击类型及敌方角色的物理和魔法防御力来计算的。暴击的伤害值是普通攻击的三倍。角色会在每次战斗后获得一定的经验值作为奖励，每累积至100时便会自动升级并会随机提升能力数据，而等级及能力值上限为20。当玩家更改角色的兵种时，角色等级将会下降至等级1，但属性则略有提高。游戏设有支持系统，当两个游戏角色有着故事性关联时（例如是成为恋人或朋友），角色的属性（如攻击力或闪避能力）将会提高。另外，游戏设有运输队功能，由主角马尔斯兼任，邻近马尔斯的角色可以存取补给品。
游戏故事分为第1部“暗黑战争篇”及第2部“英雄战争篇”两部分，而两者都以阿卡奈亚大陆为背景。第1部故事是《火焰之纹章 暗黑龙与光之剑》的重制版。故事讲述阿利提亚王国遭到邻近国家袭击，王子马尔斯在姐姐艾莉丝的帮助顺利逃脱并流亡到边境之国塔利斯，但姐姐却被俘虏。为了复兴祖国及救回被俘掳的姐姐，马尔斯必须拉拢其他势力来对抗多鲁亚帝国的军队，以及击败邪恶祭司卡涅夫及暗黑龙梅迪乌斯。在征途上，马尔斯结识了不同的朋友并与众多势力结盟，包括塔利斯的希达公主、奥利安王国的哈丁公爵、阿卡奈亚王国的妮娜公主、马其顿王国的米奈娃公主及白之贤者加托等。此外，马尔斯先在妮娜公主手上获得了阿卡奈亚王室的宝物“火焰纹章”，后来亦夺回一度被卡涅夫带走的圣剑法尔西昂。之后，手持“火焰纹章”及法尔西昂的马尔斯率领同盟军攻入多鲁亚城，并消灭了梅迪乌斯，让大陆重归和平。事件告一段落后，马尔斯把“火焰纹章”交还予阿卡奈亚王室，而哈丁公爵则与妮娜公主成婚，并成为了阿卡奈亚王国的国王。
第2部“英雄战争篇”发生在第1部的两年后。故事讲述阿卡奈亚的国王哈丁进行一连串的军事扩张，并军事占领了邻国，而马尔斯的军队亦被强制征召。正当马尔斯怀疑自己在哈丁的计划内所扮演的角色时，哈丁称他为阿卡奈亚的“叛徒”，并派遣部队追击他及相关人等。马尔斯及其部队在逃离追击后，从妮娜公主的使者手上接过“火焰纹章”，并前往魔道之都卡达因邻近地区与贤者加托会面。加托指哈丁已被卡涅夫的黑暗宝珠控制了心智，只有光之宝珠的力量才能与其抗衡并拯救哈丁。于是，马尔斯在加托的嘱咐下，前往大陆各地寻找光之宝珠以及其他三个宝珠：生命宝珠、地之宝珠以及星之宝珠，当中星之宝珠必须透过收集星之碎片来重新制成。及后，为了把哈丁从疯狂中解放出来，马尔斯决定率领军队攻击阿卡奈亚王国。在成功击败哈丁后，马尔斯等人缴获他所持有的黑暗宝珠，而他亦在恢复神智后向马尔斯道歉，但在战斗时受了重伤的他最终不治而亡。如果此时玩家仍未集齐五颗宝珠，游戏将会在此结束，马尔斯会相信卡涅夫已被击败，并很快会与梅迪乌斯展开另一场战斗。相反，如果玩家成功集齐五颗宝珠，马尔斯将会把它们镶嵌在盾牌“火焰纹章”上，并解放其真正力量，而此时盾牌的称呼将会改为“封印之盾”。
之后，加托与马尔斯等人会合，告知他卡涅夫绑架了数位女祭司，并企图利用她们作为复活梅迪乌斯的祭品，当中包括妮娜公主及马尔斯的姐姐艾莉丝。马尔斯随后率领军队前往卡涅夫进行仪式的古老神庙，先后解决了卡涅夫、夺回圣剑法尔西昂及解救了女祭司们，但梅迪乌斯仍然成功复活。复活后的梅迪乌斯化身为一条黑暗巨龙，不过它最终仍被手持圣剑法尔西昂及封印之盾的马尔斯再次击败。事件过后，阿卡奈亚大陆再度恢复和平，妮娜公主让出了大陆的王权后便失去行踪，而马尔斯则与希达成婚，并成为了这块大陆的统治者。
游戏的开发工作由火焰之纹章系列的开发商Intelligent Systems负责，而发行商任天堂则担任监督工作。1992年，Intelligent Systems在开发《火焰之纹章外传》的同时展开了本作的开发工作，连同生产则用了将近3年时间。系列创作者加贺昭三以游戏设计师及编剧的身份回归，而寺崎启祐及横井军平则分别担任游戏总监及制作人。游戏角色设计主要由小屋胜义负责，而他后来亦在《火焰之纹章 圣战之系谱》担任相关工作。游戏音乐主要由作曲家辻横由佳负责，她亦与音效设计师葛目将也一同创作游戏的原声音乐。辻横由佳后来表示，在她曾参与制作的所有火焰之纹章系列游戏内，她尤其喜爱本作。
硬件性能的增强使开发团队能够扩充游戏内容并提高图形质量。同时为吸引新玩家购买游戏，开发团队降低了游戏难度。在出现了《外传》的非常规游戏玩法后，开发团队选择回到原点，重新采用《暗黑龙与光之剑》的传统游戏玩法，游戏故事亦专注于描述马尔斯而非《外传》角色。游戏原本只包含原始故事内容，但考虑到部分玩家可能没有游玩过《暗黑龙与光之剑》，开发团队决定在游戏内加入该作的升级版本。而另一个提议则是把游戏分为重制版的《暗黑龙与光之剑》及《纹章之谜》两个部分，并各自发行。由于储存空间有限，开发团队需要削减原版《暗黑龙与光之剑》内的部分角色。另外，开发团队还缩减了马尔斯与希达之间的浪漫情节，使其变为像《外传》内类似情节一样的精炼版。游戏与系列首作一样把故事背景设定于阿卡奈亚大陆，而系列象征“火焰之纹章”则以一面镶嵌了五种魔法宝石且具有神秘力量的盾牌登场。根据加贺昭三的说法，《纹章之谜》本来是最后一款以阿卡奈亚大陆为背景的游戏，但后来的《火焰之纹章 觉醒》亦使用了相关设定。《火焰之纹章 觉醒》于2012年发行，故事背景设定于《暗黑龙与光之剑》的1000年后。
1994年1月21日，游戏于日本国内发行，适用于超级任天堂平台。本作是首款适用于超级任天堂的火焰之纹章系列游戏，同时是首款使用24Mb卡带的游戏。后来，任天堂分别在2006年12月26日、2013年4月27日及2016年6月22日透过Virtual Console释出了对应Wii、Wii U及任天堂3DS的游戏版本。2020年9月23日，任天堂透过任天堂Switch在线服务释出了对应任天堂Switch的游戏版本。与早期的火焰之纹章系列游戏一样，任天堂并未在西方世界发行本作，不过在2008年有游戏粉丝发布了修补程序，把游戏故事完整地由日语翻译为英语。
虽然没有确实的数字，但游戏是当时系列首周销量最高的作品，直至2012年才被《火焰之纹章 觉醒》超越。截至2002年，游戏已售出约77.6万份，在当时为系列销量最高的作品。
《FAMI通》的编辑在总体上对游戏持正面态度，并赞扬游戏的整体品质，以及对《暗黑龙与光之剑》的游戏玩法和故事呈现手法的改进。Nintendo Life的干沙路·洛佩斯（Gonçalo Lopes）赞扬游戏的总体叙述、技术改进及玩法，并称在该系列众多作品之中，本作是其中一款最“杰出且纯净”的作品，而与其他超级任天堂的战略角色扮演游戏相比更是杰作。
RPGamer的迈克·莫恩克（Mike Moehnke）指故事很好但未到最好，特别是因为游戏有一部分是重制了《暗黑龙与光之剑》。他表示自己享受游戏并称赞“下马”这一设计，又指出游戏的感觉像先驱者，为中后期的系列游戏带来更多及更完善的机制。另外，他又指本作作为一款超级任天堂游戏，其图形效果给人印象不深，反而战斗动画的质量较好。在游戏音乐方面，他指游戏的第1部重复使用同一首战斗主题曲，但第2部则有着更多的的变化，亦不会重用第1部的音乐。相比起第1部有点无聊的音乐，他表示第2部最后一章的主题曲更令人印象深刻。总括而言，游戏值得系列粉丝们的追捧，但其语言问题及后来系列的发展则降低了游戏的吸引力。
电击Online的编辑在游戏的20周年纪念之时，认为它不论在该系列中，还是在战略角色扮演游戏类型中，都是一款优秀作品。后来，Destructoid更把游戏列为五款火焰之纹章系列最佳游戏的其中之一。
1996年，Studio Fantasia把游戏改编为原创动画录像带，并先后在同年1月26日及4月26日发行2卷。但因销量不尽理想，Studio Fantasia未有制作续集。动画主角马尔斯由绿川光配音，而他后来亦在后续作品及其他跨界媒体（如任天堂明星大乱斗系列）继续为该角色配音。1997年，动画的英语版本于北美地区发行，由A.D. Vision负责本地化工作，相比游戏《火焰之纹章 烈火之剑》的本地化还早了6年。
1997年，任天堂在发行《火焰之纹章 圣战之系谱》后接着发行了《BS火焰之纹章 阿卡内亚战记》。这款游戏同样是战略角色扮演游戏，由Intelligent Systems开发，并被设定为《暗黑龙与光之剑》与本作的前传。游戏分为四部分，分别在1997年9月至10月之间于Satellaview发行，玩家需在指定日子及时间内通过BS-X卫星下载游戏。虽然游戏采用与其他系列游戏相同的战略游戏方式，但玩家需要在三个小时内击倒一波又一波的敌人。游戏由加贺昭三担任总监及设计师，而辻横由佳则担任音乐创作及音响监督。角色设计由新加入的铃木理华负责，而她后来亦为《火焰之纹章 觉醒》绘制角色插画。游戏的开发团队使用了与开发本作同样的技术。另外，游戏拥有角色配音，透过卫星广播实时播放。这也是系列第一次拥有角色配音。
任天堂分别在1997年9月28日、10月5日、10月12日及10月19日发行了四话内容。由于发行方法奇特且Satellaview已经停止运作，自卫星广播后此游戏变得非常稀有，玩家若想再次游玩则需要寻找安装了此游戏的卡带。但即使拥有卡带，玩家亦无法获得在当时经由卫星广播的音频。虽然《BS火焰之纹章 阿卡内亚战记》是火焰之纹章系列的一部分，并且严格来说是第五款作品，但它通常不会被列入游戏主系列内，反而被当作是本作的延伸。尽管游戏已被列入火焰之纹章系列的正统时间表，但它仍被视为系列的“非正统”游戏。
2010年，任天堂在任天堂DS平台发行了游戏的重制版本《火焰之纹章 新·纹章之谜 ～光与影的英雄～》。游戏系统基于同样发行于任天堂DS的首作重制版《火焰之纹章 新·暗黑龙与光之剑》，并增设了一名可供玩家自行创作的主角，让玩家代入角色并与马尔斯一行人并肩作战。除了原作内容之外，开发团队还把《BS火焰之纹章 阿卡内亚战记》改编为四个额外的故事情节，并新增至重制版游戏内。这亦是Intelligent Systems与任天堂首次重新发行Satellaview平台的游戏。
