耿如杞（16世纪？－1631年），字楚材，别号朴公。山东东昌府馆陶县人。明末政治人物。官至山西巡抚。崇祯二年（1629年）清兵入塞，耿如杞率兵勤王，因士兵哗变，牵连下狱问斩。
耿如杞幼时聪慧，博览知书。万历四十四年（1616年）中进士，授户部主事。天启初年（1621年），任职方郎中，出官陕西参议，迁遵化兵备副使。因不肯向魏忠贤叩拜，被魏陷害，诬陷得赃款6300金，后定秋决，得白楹所救获免。
崇祯帝即位，魏忠贤伏法。耿如杞获赦，升任太仆寺卿。崇祯元年（1628年）三月，升任都察院右副都御史，提督雁门等関兼巡抚山西。崇祯二年（1629年），清军自喜峰口入，北京大震。耿如杞会同总兵官张鸿功雄兵五千入卫北京，兵部令守通州，又调昌平，又明日调良乡，久未得饷，三日不得食，以致哗变大掠。崇祯闻知大怒，下诏逮捕如杞、鸿功。崇祯四年（1631年），斩于西市。其子耿章光上书鸣冤，后平反昭雪，弘光帝加封左佥都御史。
著有《与争录》、《抚晋疏稿》等。
有子耿章光，进士，官尚宝司卿。
