RNA测序

✍ dations ◷ 2025-05-15 12:14:09 #RNA测序

核糖核酸测序，简称RNA测序（英语：RNA Sequencing，英文简称RNA-Seq，也被称为全转录物组散弹枪法测序 Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS）是基于第二代测序技术的转录组学研究方法。RNA测序是使用第二代测序的能力，在给定时刻从一个基因组中，揭示RNA的存在和数量的一个快照的技术。首先提取生物样品的全部转录的RNA，然后反转录为c-DNA后进行的二代高通量测序，在此基础上进行片段的重叠组装，从而可得到一个个的转录本。进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解（global）。进一步说，若和下一阶段的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较，则可以得到全部的（在转录层面）基因表达的上调及下调--这就形成了表达谱，针对关键基因则可以形成你要想要的通路（英语：pathway）的构建。相较于一个静态的染色体而言，细胞内的转录物组是一个处于不断变化的动态过程。随着现在的次世代基因测序（NGS）技术的发展，使得可测得的DNA碱基覆盖面增加且样本输出的吞吐量增大。有助于对细胞内RNA转录物进行测序，提供包括选择性剪接的转录、转录后的修饰、基因融合、突变/SNPs以及基因表达量改变等细节。，RNA测序不仅能检测mRNA的转录，还能观测到包括包括总RNA和小RNA（miRNA、tRNA和核糖体RNA）在内不同尺度的RNA表达谱。RNA测序还能用来确定外显子/内含子的边界，修正之前注释的5'和3'端基因边界。未来的RNA测序研究还包括观察感染时细胞传导路径的变化和癌症中不同基因表达程度。下一代基因测序之前，对转录物组学和基因表达的研究主要基于基因表达芯片（微阵列），后者包含数以千计用于探测靶向序列的DNA探针，可以得到所有表达出转录物的表达谱。基因表达芯片之后，基因表达的系列分析（英语：Serial analysis of gene expression）（SAGE）是主要的基因分析技术。相对于RNA测序，基因表达芯片（微阵列）测序结果的覆盖面很窄，只能覆盖染色体中1千多万SNP中的常见等位基因的SNP（50万到200万）。因此，现有数据库中一般没有罕见等位基因的测序结果，而只有常见的SNP的数据，这对研究者来说是一个重大缺陷。很多癌症源于突变概率小于1%的突变，因而很难被检测出。但是，基因表达芯片（微阵列）测序在已知的等位基因检测中仍很重要，使它们非常适合监管机构批准的诊断，如囊性纤维化。有两种方法用于将原始序列读数分配给基因体特征（即组装转录体）：

相关

心律不整心脏节律不整（拉丁语：Cardiac Arrhythmia／Cardiac Dysrhythmia; 法语：Rythme cardiaque irrégulier；英语：Irregular Heartbeat，通称：心律不正、心律失常、心律失常、心律不齐），是指心
胎儿酒精综合症胎儿酒精谱系障碍（Fetal alcohol spectrum disorders，简称FASDs）又称胎儿酒精症候群，是母亲在妊娠期间酗酒对胎儿所造成的先天异常。症状包含外观异常、身材矮小、体重过轻、小
胸腺胸腺是动物的初级淋巴器官。人体内的其中一种腺体，部分骨髓免疫细胞（例如T细胞）在此成熟。胸腺在人体内的胸骨上端，左右两肺叶之间，甲状腺下方，由两叶不对称的淡红色或略带黄色的
弹簧弹簧是一种存储机械能的弹性物体。弹簧通常由弹簧钢制成。有许多弹簧设计。在日常使用中，该术语通常指的是弹簧。利用它的弹性可以控制机件的运动、缓和冲击或震动、储蓄能量
D10（Antifungals for dermatological use）（Emollients and protectives）（Preparations for treatment of wounds and ulcers）（Antipruritics, including antihistamines, anesthetics,
根特大学根特大学（荷兰语：Universiteit Gent；荷兰语缩写：UGent；英语：Ghent University或University of Ghent；法语：Universiteit Gand）是比利时学术排名第一的综合性研究型大学，世界百强大学之
南京人南京人，或称南京直立人和南京猿人，1990年代出土于南京汤山葫芦洞的南京人化石地点。目前有两例复原的南京猿人头骨。“南京猿人I号头骨”，为有病的成年女性，距今约58~62万年。“
波河平原波河河谷或称波河平原、巴丹平原（意大利语：Pianura Padana 或 Val Padana）是意大利的主要平原和地理特征之一，也是欧洲的主要工农业产区，位于波河流域。它从阿尔卑斯山一直延伸
AD基督纪年，又称为主历，是源自于基督教的纪年方法，以耶稣诞生年作为纪年的开始。在儒略历与格里高利历中，在耶稣诞生之后的纪年，称为主的年份（拉丁语：Anno Domini，缩写为A.D.；又译为主
Hsub4/subPsub2/subOsub6/sub79.5～81.5℃（一水合物）62～62.5℃（二水合物）连二磷酸（英语：Hypophosphoric acid），化学式H4P2O6，是一种无机酸，其中磷的氧化数为+4，故具有还原性。其固体多以二水合物（H4P2O6·2H2O）形式存在