贝宁国旗（法语：Drapeau du Bénin）由一块位于左方的绿色长方形、一块位于右上方的黄色长方形和一块位于右下方的红色长方形组成的横竖混排三色旗，是一面泛非颜色旗帜。
该旗于1959年首次启用，以取代殖民地时期使用的法国国旗，并随后于1960年成为当时达荷美共和国的官方旗帜。1975年，马蒂厄·克雷库领导的新政权贝宁人民共和国改变国旗图案，改为一面绿色背景，左上角有一颗红星的苏联风格旗帜。1989年发生的东欧剧变使克雷库政权陷入崩溃，该政府于1990年改国号为贝宁共和国，重新使用15年前弃用的三色国旗。
在法国殖民达荷美期间，由于巴黎政府担心当地拥有一面能够代表自己的殖民地旗帜会增加民族主义思想并引致随后的独立要求，因此执政当局一直禁止这种行为发生。但是随着二战后非洲各地的去殖民化运动陆续不断，法国政府最终于1958年12月4日正式容许达荷美成为法兰西共同体内一个拥有有限自治权的自治共和国，新成立的自治政府不久后便开始启用一面新国旗。
新旗帜于1959年11月16日采用，并于1960年8月1日达荷美共和国独立日上正式成为该国国旗。
1972年，达荷美发生军人政变，与马克思列宁主义原则结合并由马蒂厄·克雷库领导的新政府为了纪念这次革命转变，便于1975年决定把国名更改为贝宁人民共和国以及采用一面配有红色五角星并以绿色为背景的苏联风格国旗。红色象征社会主义，绿色代表以农业为主的贝宁经济，五角星代表全体贝宁人民在贝宁人民革命党的领导下，团结一致建设社会主义新国家。但是这面新国旗并没有任何法律上的正式记载，所以他只是一面事实上的贝宁国旗。
随后，由于贝宁在1980年代末期发生经济危机，以及东欧剧变使其头号支持者苏联国力严重削弱，克雷库政权最终于1990年陷入崩溃，同年8月1日，贝宁人民共和国更名为贝宁共和国，重新启用原达荷美绿黄红三色旗为国旗，并一直沿用至今。
贝宁国旗上的三种颜色包含有多层意义。首先于国家层面上，黄色与绿色间接提到位于该国北方的热带草原以及位于南方的棕榈树林，而红色则象征着为达荷美民众为反抗殖民主义统治者而付出的鲜血与牺牲。其次在非洲层面上，黄色、绿色和红色不但为代表着泛非洲主义运动的泛非颜色，也是西非知名政党非洲民主联盟（Rassemblement Démocratique Africain）的代表颜色，该政党于法国殖民非洲时期则曾在法国国民议会为法属西非黑人民众的利益发声。另一方面，这三种颜色也与埃塞俄比亚国旗上的颜色相同，而埃塞俄比亚是19世纪未20世纪初欧洲列强瓜分非洲时，仅有的两个长期维持独立主权的非洲国家之一（另一个国家为利比里亚），包括贝宁在内的众多非洲国家出于对埃塞俄比亚保持非洲荣光的敬意，在国旗设计上效仿了埃塞俄比亚的红黄绿三色组合。
